Serial multiomics uncovers anti-glioblastoma responses not evident by routine clinical analyses
Notice bibliographique
Résumé
Recurrent glioblastoma (rGBM) remains incurable. One barrier to the development of effective rGBM therapies is the difficulty in collecting posttreatment tumor tissue. Serial multiomic assays from longitudinal rGBM biopsies may uncover tumor responses to a treatment. Here, we obtained 97 serial rGBM biopsy cores over 4 months from the first two patients participating in a clinical trial of repeated intratumoral dosing of the immunotherapeutic agent CAN-3110. Multiomic analysis of the biopsy cores revealed therapeutic effects, including longitudinal and spatial reshaping of the rGBM's microenvironment, expansion of new T cell tissue-resident effector memory clonotypes against CAN-3110 epitopes and other undetermined antigens, and expression of human leukocyte antigen (HLA)-presented immunopeptides, including cancer testis antigens. Moreover, serial integrated multimodal analyses provided evidence of therapeutic responses to CAN-3110 despite traditional magnetic resonance imaging indicating progression. Clinically, the two treated patients achieved a pathologic response or stable clinical disease, respectively. These results show the value of longitudinal tissue sampling to understand rGBM's evolution during administration of an investigational therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».