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Enregistrement W4414941487 · doi:10.1126/scitranslmed.adv2881

Serial multiomics uncovers anti-glioblastoma responses not evident by routine clinical analyses

2025· article· en· W4414941487 sur OpenAlexaff
Alexander Ling, Jennifer Gantchev, Michael C. Prabhu, Sreyashi Basu, Ryuhjin Ahn, Alicia D. D’Souza, Nafisa Masud, Anna Ball, Odysseas Nikas, Genaro R. Villa, Michael S. Regan, Gerard Baquer, Georges Ayoub, Charles A. Whittaker, Zaki Abou-Mrad, Andres Santos, Charles Couturier, Dina ElHarouni, Jayne Vogelzang, Kenny Yu, Hong Chen, Zhong He, Wen Jiang, Calixto‐Hope G. Lucas, Haley E. Sax, Frederick F. Lang, Vinay K. Puduvalli, Viviane Tabar, Cameron Brennan, Adrienne Boire, Matthias Holdhoff, Chetan Bettegowda, Michael J. Cima, Isaac H. Solomon, Ying Yuan, Paul P. Tak, Padmanee Sharma, Forest M. White, Keith L. Ligon, Nathalie Y.R. Agar, David A. Reardon, Giacomo Oliveira, E. Antonio Chiocca, Jennifer Wiley, Kathryn Partridge, Rameen Beroukhim, Amanda Spearman, Ugonma Chukwueke, Patrick Y. Wen, A. Chiocca, Sarah Frisken, Brian J. Coyne, Daniel Triggs, Michal O. Nowicki, Himanshu Soni, Raziye Piranlioglu, Marco Mineo, Ana Montalvo Landivar, Sylwia A. Stopka, Md Amin Hossain, Seth Malinowski, Sonam Bhatia, Thomas P. Quinn, Marla J. Polk, Alexsandra Espejo, Jingjing Sun, Yulong Chen, Sonali Jindal, Jason T. Huse, Lisa Norberg, Sangeeta Goswami, Betty Y. Kim, Kadir C. Akdemir, Brittany C. Parker Kerrigan, Douglas Nielsen, Jian Hu, Pratibha Sharma, Chetna Wathoo, Gregory M. Buchold, Jiyong Liang, Stuart S. Levine, Qun Cao, Alexei Stortchevoi, Shahiba Ogilvie, Alexandra Giantini-Larsen, Kelsey Hopland, Yuval Elhanati, Rachel Estrera, Isaiah Osei-Gyening, Tejus Bale, Christopher Douville, Jordina Rincon Torroella, Vasilena Gocheva, Francesca Barone, Jennifer Moliterno

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer Institute
Mots-clésBiopsyClinical trialImmunotherapyEffectorAntigenSampling (signal processing)Epitope

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recurrent glioblastoma (rGBM) remains incurable. One barrier to the development of effective rGBM therapies is the difficulty in collecting posttreatment tumor tissue. Serial multiomic assays from longitudinal rGBM biopsies may uncover tumor responses to a treatment. Here, we obtained 97 serial rGBM biopsy cores over 4 months from the first two patients participating in a clinical trial of repeated intratumoral dosing of the immunotherapeutic agent CAN-3110. Multiomic analysis of the biopsy cores revealed therapeutic effects, including longitudinal and spatial reshaping of the rGBM's microenvironment, expansion of new T cell tissue-resident effector memory clonotypes against CAN-3110 epitopes and other undetermined antigens, and expression of human leukocyte antigen (HLA)-presented immunopeptides, including cancer testis antigens. Moreover, serial integrated multimodal analyses provided evidence of therapeutic responses to CAN-3110 despite traditional magnetic resonance imaging indicating progression. Clinically, the two treated patients achieved a pathologic response or stable clinical disease, respectively. These results show the value of longitudinal tissue sampling to understand rGBM's evolution during administration of an investigational therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,259
Score d'incertitude au seuil0,617

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,466
Écart entre enseignants0,373 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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