A short SUMOylation tag modulates transcription factor activity
Notice bibliographique
Résumé
SUMOylation is a posttranslational modification that regulates multiple aspects of protein biology, including the activity of transcription factors such as p53. Although strategies exist to decrease protein SUMOylation in a targeted manner, options are limited to increase SUMOylation in a protein-specific manner. Here, we developed a strategy to induce SUMOylation of a target protein relying on its genetic fusion to a 32-residue tag termed ZNF and composed of the SUMO E3 module of ZNF451. Through in vitro and cell-based assays, we establish that this SUMOylation tag promotes robust poly/multi-SUMOylation of p53, used as a model substrate, with a strong preference for SUMO2/3 as compared to SUMO1. Mass spectrometry experiments performed on transfected HEK293 cells stably expressing a modified form of SUMO3 indicate that lysine 386, the main SUMOylation acceptor site of p53, is the primary target of ZNF-mediated SUMOylation. Increased SUMOylation represses p53 transcriptional activity in luciferase reporter assays, a result compatible with the general repressive effects of SUMOylation on transcription factor activity. Finally, fusion of ZNF to HSF1 and DNMT3A also increase their SUMOylation level, showcasing that ZNF could potentially be used to promote the SUMOylation of a broad range of proteins implicated in DNA metabolism. Overall, this strategy will facilitate the investigation of the impact of increased SUMOylation on specific protein substrates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».