From Metabolism to Mutation: The Multifaceted Roles of Deaminases in Biological Systems
Notice bibliographique
Résumé
Deaminases are versatile enzymes present across all domains of life, playing pivotal roles in metabolism, cellular and organ development, heme and vitamin biosynthesis, toxin modulation, antibiotic degradation, the modification of nucleobases, and the mutation of RNA and DNA. This review explores the structural and functional diversity of deaminases, highlighting their mechanisms and evolutionary adaptations. Deaminases catalyze the removal of amine groups, typically using metal cations and proton shuttles to facilitate hydroxyl group incorporation, with some reactions employing pyridoxal 5'-phosphate (PLP) as a cofactor. The review categorizes deaminases based on their substrates, including porphobilinogen, amino sugars, amino acids, and nucleobases. Particular emphasis is placed on nucleobase deaminases due to their roles in RNA/DNA editing and mutagenesis which have significant implications in immune response, cancer progression, and viral defense mechanisms. Structural insights reveal the diverse evolutionary pathways of these enzymes, from simple single-domain forms to complex multi-domain configurations that enable processive deamination of polynucleotides. Through a comprehensive analysis of deaminase families—PBGD, sugar deaminases, amino acid deaminases, and nucleobase deaminases—this review underscores their biological significance and potential applications in agriculture, medicine, and biotechnology, providing a foundational understanding for future research.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».