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Enregistrement W4414957617 · doi:10.1073/pnas.2502741122

Regulation of an lncRNA <i>irf8</i> by the Ikzf1/Myb complex drives neutrophil development

2025· article· en· W4414957617 sur OpenAlexaff
Yuepeng He, Li Yang, Xue Huang, Jiangyong He, Shengnan Liu, Yalan Xiao, Zhigang Li, Yu Hou, Lingfei Luo, Fangying Zhao, Li Li

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesChongqing Institute of Green and Intelligent Technology, Chinese Academy of SciencesChongqing Medical UniversitySouthwest UniversityChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMacrophageNeutrophil extracellular trapsInnate immune systemInflammationZebrafishImmune systemIRF8MyeloidIntegrin alpha M

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As critical executors of the immune system, neutrophils provide an immediate inflammatory response for the clearance of debris and microbes, which is essential for the protection of health. Developmentally, neutrophils and macrophages share common progenitors, whose fate is tightly controlled by transcriptional programs. Dysregulation of these programs causes severe hematological disorders, including neutropenia, neutrophilia, leukemia, and inflammatory disorders. However, the mechanisms underlying the generation of neutrophils through these programs are poorly understood. Here, we revealed that Ikzf1 and Myb were enriched in neutrophils. Overactivation of Ikzf1 promoted neutrophil generation while suppressing macrophage emergence. Conversely, the simultaneous loss of Ikzf1 and Myb, but not the individual mutations, drastically impaired neutrophil production and enlarged the macrophage pool in both zebrafish and mice. Mechanistically, Ikzf1 and Myb formed a complex that targeted irf8 and induced the expression of a long noncoding RNA (lncRNA), irf8-2 , through a regulatory element. LncRNA irf8-2 biased neutrophil commitment by modulating irf8 dosage via Zfp36l1. The deletion of irf8-2 resulted in defective neutrophil development and enhanced macrophage production. However, a partial ratio of neutrophils and macrophages was restored when Ikzf1, Myb, and Irf8 were all compromised. Overall, our study reveals that Ikzf1 and Myb cooperatively bias neutrophil development against Irf8 via the lncRNA irf8 -2 and Zfp36l. This study provides previously uncharacterized insights into the conserved molecular balance between neutrophil and macrophage development during myelopoiesis, with potential implications for understanding and treating myeloid disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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