Distinct biological subtypes of chronic GVHD after pediatric hematopoietic cell transplantation
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT: Chronic graft-versus-host-disease (cGVHD) is the primary nonrelapse limitation to a successful hematopoietic cell transplantation and is largely treated as a single biological entity. We hypothesized that there exist different biological subtypes of cGVHD. Using the Applied Biomarkers of Late Effects of Childhood Cancer (ABLE) network database, which is derived from the largest pediatric cGVHD cohort worldwide, we applied clustering analysis to subtype patients with cGVHD from the ABLE1.0 and 2.0 studies (51 patients with cGVHD and 158 with non-cGVHD). We found 3 distinct cGVHD subtypes: cGVHD-1 was characterized by an effector memory T-cell, cytotoxic natural killer cell, and early precursor B-cell predominant pattern; cGVHD-2 was phosphatidylcholine, cytokine, and plasma cell predominant; and cGVHD-3 had more naïve CD4+ T cells and naïve regulatory T cells, had later onset, and was the only subtype with measurable T-cell receptor excision circles. We partially replicated these subtypes using metabolomic data from a separate pediatric cohort of the Children's Oncology Group trial ASCT0031 (33 patients with cGVHD and 39 with non-cGVHD). Furthermore, cGVHD-1 was associated with serotherapy (predominantly antithymocyte globulin) exposure, and cGVHD-3 was associated with receiving peripheral blood stem cells from donors, total body irradiation, and no previous acute GVHD. cGVHD-2 was associated with liver involvement and cGVHD-2 and -3 with de novo cGVHD. Overall, none of the subtypes were closely associated with organ involvement. Contrasting each subtype against patients with non-cGVHD, the 3 subtypes shared common markers, all of which were used in our previous cGVHD diagnostic classifier. These findings suggest the presence of distinct biological subtypes of cGVHD that may help guide therapeutic strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».