Chain formation mediated by Escherichia coli immunoglobulin-binding proteins EibD and EibG depends on expression levels and localization of proteins
Notice bibliographique
Résumé
Escherichia coli expresses immunoglobulin-binding proteins (Eib), a subgroup of trimeric autotransporter adhesins (TAA). Subtypes of Eib proteins mediate unique chain-like adherence patterns and autoaggregation. This study investigates the mechanisms underlying chain formation by EibG and EibD; a chain-forming phenotype of the latter has not been previously described. Using constitutive expression systems, we demonstrate that moderate-level expression of EibG and EibD lead primarily to chain formation, whereas higher expression levels predominantly result in clump formation. Notably, chain and clump formation are not mutually exclusive and can occur simultaneously. Selective deletion of the full head domain, but not the N-terminal domain alone, abolished chain formation, highlighting its critical role. Fluorescence microscopy of mixed cultures showed that chains form through homotypic protein-protein interactions. Investigation revealed EibD and EibG were predominantly localized at cell poles, corresponding to sites of intercellular contact. Functional investigations showed that chain-forming strains exhibited enhanced adhesion to plastic surfaces, a key step in biofilm formation, without affecting autoaggregation. These showed Eib-mediated chain formation depends on protein expression levels, domain architecture, and localization, contributing to bacterial adhesion and potentially pathogenicity. Understanding interactions provides insights into TAA-mediated chain formation and autoaggregation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».