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Enregistrement W4415004877 · doi:10.1667/rade-25-00064.1

Genomic Loci of Radiation-induced Lung Disease in a Mouse Model: Refinement and Candidate Gene Analysis

2025· article· en· W4415004877 sur OpenAlexaff
Ian Johnson, Vassilena Sharlandjieva, Laetitia Sabatier, Derek Hyde, Erin E. McCurry, Kirsty Milligan, Christina K. Haston

Notice bibliographique

RevueRadiation Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEffects of Radiation Exposure
Établissements canadiensChristie (Canada)McGill UniversityUniversity of British Columbia, Okanagan Campus
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCandidate geneLocus (genetics)Respiratory distressAllelePneumonitisCongenicRespiratory diseaseFibrosisLung

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Susceptibility to radiation-induced lung disease differs among people and among inbred strains of mice; C3H/HeJ mice develop early onset distress from pneumonitis and C57BL/6J mice present later onset pneumonitis with fibrosis. Previous studies revealed C3H/HeJ alleles at a 28 Mb locus on chromosome 2 to be linked to early onset distress and at an 18 Mb locus on chromosome 17 (called Radpf1 for radiation-induced pulmonary fibrosis-1) to decrease fibrosis in whole-thorax irradiated mice. To potentially reduce these genomic intervals, parental chr17-subcongenic mice with 0.71 Mb of C3H/HeJ alleles, and chr 2-congenic mice with region-spanning C3H/HeJ alleles from 95 to 123 Mb, and four lines of subcongenic mice received 16 Gy whole thorax irradiation and were assessed for onset of respiratory distress and histological lung disease at distress. One hundred percent of irradiated C3H/HeJ and C57BL/6J mice exhibited respiratory distress from pneumonitis and pneumonitis with fibrosis (6.8% of lung), respectively, while 18/19 chr17-subcongenic mice survived to 25 weeks post-treatment without symptoms of distress and with significantly decreased radiation-induced pulmonary fibrosis (0.3% of lung, P = 0.002). Of the chr2-subcongenics, mice of one line, which we refer to as Pneum1 (pneumonitis one), succumbed at an average of 20.2 ± 1.1 weeks postirradiation in females and 26.3 ± 1.2 weeks in males (P > 0.22 vs. congenic mice), reducing this locus to 5.6 Mb. Bioinformatic analyses revealed 114 candidate genes within these reduced intervals, with effects on pathways including on immune pathways. Mapping refined genetic susceptibility to radiation-induced lung disease in mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,467
Score d'incertitude au seuil0,491

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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