Genomic Loci of Radiation-induced Lung Disease in a Mouse Model: Refinement and Candidate Gene Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Susceptibility to radiation-induced lung disease differs among people and among inbred strains of mice; C3H/HeJ mice develop early onset distress from pneumonitis and C57BL/6J mice present later onset pneumonitis with fibrosis. Previous studies revealed C3H/HeJ alleles at a 28 Mb locus on chromosome 2 to be linked to early onset distress and at an 18 Mb locus on chromosome 17 (called Radpf1 for radiation-induced pulmonary fibrosis-1) to decrease fibrosis in whole-thorax irradiated mice. To potentially reduce these genomic intervals, parental chr17-subcongenic mice with 0.71 Mb of C3H/HeJ alleles, and chr 2-congenic mice with region-spanning C3H/HeJ alleles from 95 to 123 Mb, and four lines of subcongenic mice received 16 Gy whole thorax irradiation and were assessed for onset of respiratory distress and histological lung disease at distress. One hundred percent of irradiated C3H/HeJ and C57BL/6J mice exhibited respiratory distress from pneumonitis and pneumonitis with fibrosis (6.8% of lung), respectively, while 18/19 chr17-subcongenic mice survived to 25 weeks post-treatment without symptoms of distress and with significantly decreased radiation-induced pulmonary fibrosis (0.3% of lung, P = 0.002). Of the chr2-subcongenics, mice of one line, which we refer to as Pneum1 (pneumonitis one), succumbed at an average of 20.2 ± 1.1 weeks postirradiation in females and 26.3 ± 1.2 weeks in males (P > 0.22 vs. congenic mice), reducing this locus to 5.6 Mb. Bioinformatic analyses revealed 114 candidate genes within these reduced intervals, with effects on pathways including on immune pathways. Mapping refined genetic susceptibility to radiation-induced lung disease in mice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».