BCG Vaccination at Birth Shapes the TCR Usage and Functional Profile of MR1T Cells at 9 Weeks of Age
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Tuberculosis (TB) is the leading infectious disease killer worldwide and children suffer disproportionately. The ongoing burden of disease, despite widespread vaccination with BCG, highlights the need for novel vaccines. MR1-restricted T (MR1T) cells recognize small molecules, including microbial-derived molecules, presented by the monomorphic MHC class 1- related molecule (MR1). They have both “innate” effector capacity, allowing them to quickly respond to pathogens including Mycobacterium tuberculosis (Mtb), while also having adaptive features (effector memory cell surface phenotype and selective TCR usage). Feasibility of an MR1T cell-based vaccination remains unexplored and critical to this is whether or not MR1T cells possess the capacity for immunological memory. To begin to address this question, peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were collected at 9-weeks of age from healthy term- infants in South Africa, who had either received BCG vaccination at birth (n=10) or who had BCG vaccination delayed (n=10). MR1/5-OP-RU tetramer positive cells were sorted using flow cytometry and single-cell RNA and TCR-seq was performed. Ex-vivo MR1T cells from vaccinated infants demonstrated increased expression of type I interferon response genes consistent with a cytokine mediated response to BCG vaccination. Using the TCR clustering algorithm TCRdist3, similar TCRs were grouped together, revealing a cluster significantly enriched in BCG-vaccinated infants. This cluster exhibited elevated expression of pro- inflammatory and cytotoxic genes, consistent with a recall response to prior vaccination and evidence of possible recognition of Mtb. This work provides the first step in addressing if MR1T cells demonstrate immunological memory, however, further work is needed to understand if these clonal expansions persist and possess the capacity for antigenic recall.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».