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Enregistrement W4415093681 · doi:10.1094/pbiomes-05-25-0033-r

Root Microbial Functions and Robust Network Drive High-Yielding Canola Genotype

2025· article· en· W4415093681 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePhytobiomes Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMicrobial Metabolites in Food Biotechnology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesUniversity of Saskatchewan
Mots-clésMetagenomicsMedicago truncatulaAbiotic componentCanolaMetaproteomicsMicrobiomeGenotypeMicrobial population biologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants and their root microbiomes have coevolved complex relationships that influence growth and development. Although plant genotype is known to shape root microbiomes, a detailed understanding of this interplay remains limited. We used shotgun metagenomic sequencing to examine the composition, function, and microbial association networks of root bacterial communities in two Brassica napus (canola) genotypes with contrasting yields: NAM-23 and NAM-30. Root samples were collected at three developmental stages (vegetative, flowering, and maturation) across three field sites. Growth stage significantly influenced both alpha and beta diversity, but not Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway functions. Genotype had minimal effect on overall diversity and function but specifically influenced the recruitment of certain bacterial taxa and the topology of microbial association networks. NAM-23, the high-yielding genotype, was enriched in plant-growth-promoting bacteria ( Rahnella) and genes related to carbohydrate and phosphorus metabolism. Additionally, NAM-23 exhibited a more robust and connected microbial network, with higher degree, betweenness, and clustering coefficient, and more genotype-specific hub taxa, traits often associated with enhanced resistance to abiotic and biotic stresses and potentially contributing to its higher yield. Our findings provide a high-resolution view of genotype-specific interactions with the root microbiome, highlighting key microbial features associated with high yield. These insights support microbiome-informed strategies for crop improvement in sustainable agriculture. [Formula: see text] Copyright © 2026 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,513
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle