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Enregistrement W4415108402 · doi:10.1371/journal.pgen.1011802

Twitching motility suppressors reveal a role for FimX in type IV pilus extension dynamics

2025· article· en· W4415108402 sur OpenAlexafffund
Nathan Roberge, Nathan Yuen, Hanjeong Harvey, Taylor J. Ellison, Courtney K. Ellison, Lori L. Burrows

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsDamon Runyon Cancer Research Foundation
Mots-clésPilusMutantEffectorRegulatorMotilityBeta-galactosidaseSuppressorMutationSuppressor mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Pseudomonas aeruginosa, retractable protein filaments called type IV pili (T4P) facilitate surface adherence, sensing, and directional movement known as twitching motility. T4P are necessary for the bacteria to engage in surface-associated behaviors, including establishing acute infections. Pilus extension is driven by the hexameric ATPase, PilB, at the base of the T4P nanomachine in coordination with various protein regulatory effectors. The cyclic-di-GMP binding protein, FimX, works with PilB to mediate normal extension processes, though how this effector controls pilus assembly remains unclear. To explore the role of FimX in T4P function, we leveraged the significant ΔfimX twitching motility deficit to screen for mutants capable of overcoming this phenotype. We identified suppressor mutations that increase twitching in a ΔfimX background, mapping primarily to cyclic-AMP homeostatic machinery or to PilB, the FimX target. Distinct suppressor mutations in PilB increased ATP hydrolysis in vitro and the activity of each suppressor was subject to modulation by FimX. Using microscopy to monitor the extension dynamics of fluorescently labelled T4P, we showed that ΔfimX mutants produce slow-to-extend, short pili, a phenotype that is rescued by mutations enhancing PilB ATP hydrolysis and/or re-introduction of FimX. Together, these data may imply FimX normally acts as a regulator of PilB activity in cells, potentially enabling P. aeruginosa to fine-tune pilus extension dynamics in response to environmental cues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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