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Enregistrement W4415112439 · doi:10.1016/j.cmpb.2025.109095

A generative adversarial optimization strategy for predicting counterfactual trajectories of grey matter atrophy

2025· article· en· W4415112439 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueComputer Methods and Programs in Biomedicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Sclerosis Research Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesLabEx PRIMESLabEx Chimie des Systèmes ComplexesUniversité de LyonAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésCounterfactual thinkingAdversarial systemGenerative grammarGenerative modelCounterfactual conditional

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVE: Counterfactual explanations offer valuable insights into the behavior of machine learning models by describing hypothetical scenarios that would lead to different outcomes. In the biomedical domain, such as neuroimaging for Multiple Sclerosis (MS), counterfactual reasoning has the potential to enhance understanding of disease mechanisms and treatment effects. However, generating anatomically plausible counterfactuals that generalize well to unseen data remains a major challenge. METHODS: We propose an optimization-based adversarial framework for generating realistic counterfactual trajectories of cortical grey matter (GM) thickness in MS patients. The method uses the gradients of a pre-trained MS classifier to guide the generation process towards a desired disease state while enforcing anatomical constraints and disentangling disease-relevant signals from confounding factors such as age and sex. RESULTS: Our approach successfully produces plausible counterfactual GM thickness maps that reflect known anatomical patterns of MS progression. The generated trajectories maintain consistency with biological structure and improve interpretability of model decisions. On held-out test data, our method achieves a classification AUC of 0.893 and demonstrates strong confounder preservation, with a Mean Absolute Deviation Error (MADE) of 8.72 years for age and 0.14 for sex, and a cosine distance of 0.11 when comparing original and counterfactual instances. The ability to alter the predicted disease state while preserving the confounding variables highlights the strong disentanglement capability of our model. These results confirm the method's effectiveness in generating realistic and anatomically coherent counterfactuals, outperforming state-of-the-art baselines across multiple metrics. CONCLUSIONS: This study introduces a novel counterfactual generation method that provides interpretable, anatomically grounded explanations of MS progression. The framework serves as a powerful tool for hypothesis generation and model validation in biomedical imaging studies, particularly where understanding disease mechanisms is crucial.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,894
Score d'incertitude au seuil0,516

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle