A generative adversarial optimization strategy for predicting counterfactual trajectories of grey matter atrophy
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Counterfactual explanations offer valuable insights into the behavior of machine learning models by describing hypothetical scenarios that would lead to different outcomes. In the biomedical domain, such as neuroimaging for Multiple Sclerosis (MS), counterfactual reasoning has the potential to enhance understanding of disease mechanisms and treatment effects. However, generating anatomically plausible counterfactuals that generalize well to unseen data remains a major challenge. METHODS: We propose an optimization-based adversarial framework for generating realistic counterfactual trajectories of cortical grey matter (GM) thickness in MS patients. The method uses the gradients of a pre-trained MS classifier to guide the generation process towards a desired disease state while enforcing anatomical constraints and disentangling disease-relevant signals from confounding factors such as age and sex. RESULTS: Our approach successfully produces plausible counterfactual GM thickness maps that reflect known anatomical patterns of MS progression. The generated trajectories maintain consistency with biological structure and improve interpretability of model decisions. On held-out test data, our method achieves a classification AUC of 0.893 and demonstrates strong confounder preservation, with a Mean Absolute Deviation Error (MADE) of 8.72 years for age and 0.14 for sex, and a cosine distance of 0.11 when comparing original and counterfactual instances. The ability to alter the predicted disease state while preserving the confounding variables highlights the strong disentanglement capability of our model. These results confirm the method's effectiveness in generating realistic and anatomically coherent counterfactuals, outperforming state-of-the-art baselines across multiple metrics. CONCLUSIONS: This study introduces a novel counterfactual generation method that provides interpretable, anatomically grounded explanations of MS progression. The framework serves as a powerful tool for hypothesis generation and model validation in biomedical imaging studies, particularly where understanding disease mechanisms is crucial.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle