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Enregistrement W4415128809 · doi:10.1101/2025.10.10.25337504

Cohort Profile: Swiss Personalized Health Network Cohort Consortium

2025· preprint· en· W4415128809 sur OpenAlexaff
Murielle Bochud, Samuel EB Tiali, Jan Armida, Rita Wissa, Sabine Österle, Juan Manuel Blanco, Jean Pierre Ghobril, Yves Henchoz, Valérie Pittet, Pascal Benkert, Jens Kühle, Enrique Castelao, Martin Preisig, Carlo Chizzolini, Huldrych F. Günthard, Katharina Kusejko, Medea Imboden, Nicole Probst‐Hensch, Michael Koller, Pedro Marques‐Vidal, Péter Vollenweider, Menno Pruijm, Andri Rauch, Camillo Ribi, Almut Scherer, Christoph Tellenbach, Belén Ponte, Julien Vaucher, Isabel Fortier

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueHealth and Medical Studies
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesSchweizerische Multiple Sklerose GesellschaftSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungChinese Society of Clinical OncologyMultiple Sclerosis SocietyBiogenGlaxoSmithKlineAstraZenecaBristol-Myers SquibbNational Science Foundation
Mots-clésCohortHarmonizationCohort studyData sharingBiobankMEDLINEMetadata

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Swiss cohort studies provide high-quality longitudinal data, but finding and comparing relevant studies across cohorts has historically been challenging. The Swiss Personalized Health Network Cohort Consortium (SPHN-CC) was established to address these limitations by creating the first coordinated network of Swiss cohort studies within the internationally recognized Maelstrom Research catalogue. Methods Participating cohorts were invited in 2021–2022, including longitudinal and cross-sectional studies with 1010-21 993 participants. Data collected include questionnaires, physical and cognitive assessments, administrative records, and biological samples. Variables were classified into 18 domains and 134 subdomains, and an online metadata catalogue was implemented to document study designs, explore variable content, and assess harmonization potential. Results The catalogue enables researchers to identify study-specific and harmonized variables for co-analysis. Core variables, such as age, sex/gender, anthropometrics, and medication use, are widely available, while other variables vary across cohorts. Harmonization assessments demonstrate that several key variables can be co-analyzed across multiple studies, supporting collaborative research with over 37’000 participants. A use case illustrates the potential for harmonizing and co-analyzing data across studies. Conclusions The SPHN-CC strengthens Swiss cohort research by enhancing data discoverability, supporting harmonization, and facilitating cross-cohort and international research, providing a model for more efficient use of high-value longitudinal data. Key features The Swiss Personalized Health Network Cohort Consortium aims to optimize the use of data and biological samples collected by publicly funded Swiss cohort studies. Up to now, 10 studies participated in the initiative. From 1988 to 2020 they together recruited over 50 000 participants. Recruitment remains active for six of the studies. Most cohorts are still collecting data and biological samples. All studies collected information from questionnaires, nine also collected biospecimens, seven performed physical measurements, two conducted cognitive assessments and two retrieved information from administrative databases at least once during the life course of the study. An online study and variables catalogue was developed to help researchers determine whether data collected might serve to answer the specific research questions they would like to address and, if relevant, may be harmonized and co-analyzed across studies. Access to the metadata catalogue is open and free.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,138

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,009
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0410,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,446
Écart entre enseignants0,373 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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