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Enregistrement W4415133439 · doi:10.1101/2025.10.11.681803

Lipid tail chemistry regulates selective membrane interactions with DNA nanoprobes and DNA-based coacervates

2025· preprint· en· W4415133439 sur OpenAlexaff
Yuhan Li, Nicholas G. Horton, Derek K. O’Flaherty, Roger Rubio‐Sánchez, Claudia Bonfio

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE Framework ProgrammeBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversité de StrasbourgAgence Nationale de la RechercheEuropean Commission
Mots-clésAmphiphileDegree of unsaturationMembraneLipid bilayerSurface chargePhospholipidCell membraneStatic electricity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Biological membranes actively regulate their composition to fine-tune their packing, fluidity, phase and surface charge, key properties that influence biomolecular interactions driving essential cellular pathways. While membrane surface charge is often attributed to specific lipid headgroups, the role of acyl-chain chemistry in modulating the interplay between these biophysical membrane properties remains unexplored. Here, we systematically investigate how acyl-chain length and saturation modulate lipid packing, fluidity, and membrane surface charge in zwitterionic lipid membranes. Using amphiphilic DNA nanoprobes as model charged biomolecules, we describe the interplay between packing, fluidity, phase and charge, identifying a packing-dependent guiding principle for membrane interactions that persists in the presence of anionic lipids. We also demonstrate that the identity and hydrophobicity of membrane anchors in nanoprobes significantly influence their binding to membranes. By integrating acyl-chain chemistry and membrane biophysical properties into design criteria for biomolecular attachment, our findings provide a mechanistic framework for engineering membrane interactions with both DNA nanoprobes and DNA-based coacervates. Beyond direct application to biomimetic platforms and synthetic cell engineering, these insights are relevant to lipid-based vaccine nanotechnologies and a fundamental understanding of membrane-biomolecule interactions in living cells. Abstract Figure

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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