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Enregistrement W4415155651 · doi:10.1101/2025.10.13.681937

Shifted assembly and function of mSWI/SNF family subcomplexes underlie targetable dependencies in dedifferentiated endometrial carcinomas

2025· preprint· en· W4415155651 sur OpenAlexafffund
Jessica D. St. Laurent, Grace D. Xu, Alexander W. Ying, Bengul Gokbayrak, Ajinkya Patil, João A. Paulo, Kasey S. Cervantes, Shary Chen, William W. Feng, Akshay Sankar, Daniel D. Samé Guerra, Jun Qi, Dana S. Neel, Jason L. Hornick, David L. Kolin, Steven P. Gygi, David G. Huntsman, Yemin Wang, Cigall Kadoch

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmyloidosis: Diagnosis, Treatment, Outcomes
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Research InstituteReproductive Scientist Development Program
Mots-clésChromatinFunction (biology)Cell growthGeneChromatin remodelingARID1AEndometrial cancerCancerHEK 293 cellsRegulation of gene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mammalian SWI/SNF (mSWI/SNF) family of chromatin remodelers govern cell type-specific chromatin accessibility and gene expression and assemble as three distinct complexes: canonical BAF (cBAF), Polybromo-associated BAF (PBAF), and non-canonical BAF (ncBAF). ARID1A and ARID1B are paralog subunits that specifically nucleate the assembly of cBAF complexes and are frequently co-mutated in highly aggressive dedifferentiated/undifferentiated endometrial carcinomas (DDEC/UECs). Here, in cellular models and primary human tumors, we find that ARID1A/B deficiency-mediated cBAF loss results in increased ncBAF and PBAF biochemical abundance and chromatin-level functions to maintain the DDEC oncogenic state. Further, treatment with clinical-grade SMARCA4/2 ATPase inhibitors markedly attenuates DDEC cell proliferation and tumor growth in vivo and synergizes with carboplatin-based chemotherapy to extend survival. These findings reveal the oncogenic contributions of shifted mSWI/SNF family complex stoichiometry and resulting gene regulatory dysregulation and suggest therapeutic utility of mSWI/SNF small molecule inhibitors in DDEC/UEC and other cBAF-disrupted cancer types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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