MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4415157283 · doi:10.7554/elife.106699.2

Degradation of LMO2 in T cell leukaemia results in collateral breakdown of transcription complex partners and causes LMO2-dependent apoptosis

2025· article· en· W4415157283 sur OpenAlexaff
Naphannop Sereesongsaeng, Carole J. R. Bataille, Angela J. Russell, Nicolas Béry, Fernando J. Sialana, Jyoti S. Choudhary, Ami Miller

Notice bibliographique

RevueeLife · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUbiquitin ligaseTranscription factorIntracellularUbiquitinTernary complexProteolysisTranscription (linguistics)HEK 293 cells

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract LMO2 is an intrinsically disordered transcription factor activated in T cell leukaemia that is difficult to target. It forms part of a multiprotein complex that has bipartite DNA binding through heterodimeric bHLH and GATA proteins. To determine if degradation of LMO2 in the context of T-ALL has therapeutic potential, a chimaeric intracellular antibody has been developed fusing an anti-LMO2 single domain variable region with one of three E3 ligases to create biodegraders. The intracellular binary interaction of these biodegraders with LMO2 leads to its proteosomal degradation but, in addition, concomitant loss of bHLH proteins that associate with LMO2 in the DNA-binding complex. Chemical compound surrogates of the intracellular antibody paratope (called Abd compounds) have been modified to create proteolysis targeting chimaeras (PROTACs) for orthogonal assays of effects of LMO2 degradation. These form a ternary complex with LMO2 and E3 ligase in leukaemia cells that induces degradation of LMO2, and is also accompanied by loss of associated bHLH proteins. This is accompanied by T-ALL growth inhibition, alterations in proteins involved in cell cycling and instigation of apoptosis. These effects do not occur in the absence of LMO2. Our work demonstrates that degradation of LMO2 affects T-ALL and the lead compounds can eventually be developed into drugs for patient treatment. Our work describes methods for drug discovery starting with antibody fragments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,359

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeLifeMême sujetT-cell and Retrovirus StudiesTravaux en français237 207