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Enregistrement W4415185722 · doi:10.1016/j.prevetmed.2025.106723

Automating classification of veterinary biosecurity recommendations using machine learning

2025· article· en· W4415185722 sur OpenAlex
Vitória R Lima-Campêlo, Mariana Fonseca, M.P. Morin, Faustin Farison, William Lelorel Nankam Nguekap, Karol G Solano-Suarez, Herman W. Barkema, Waseem Shaukat, D.L. Renaud, D.F. Kelton, Gilles Fecteau, Jean‐Philippe Roy, Pablo Valdés Donoso, Solène Le Manac'h, Juan Carlos Arango‐Sabogal, Marie-Ève Paradis, Nancy Beauregard, Manon Racicot, Cécile Aenishaenslin, Simon Dufour

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevuePreventive Veterinary Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueText and Document Classification Technologies
Établissements canadiensAssociation des Médecins Vétérinaires du QuébecUniversity of GuelphUniversity of CalgaryUniversité de MontréalCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesVille de QuébecNovalaitUniversité de MontréalDairy Farmers of CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Mots-clésBiosecurityRandom forestSupport vector machineNaive Bayes classifierConsistency (knowledge bases)Linear discriminant analysisBayes' theoremQuality assurance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ProAction® is a mandatory Canadian milk quality assurance program that requires dairy farmers to conduct a biosecurity risk assessment with a veterinarian. Based on this assessment, the veterinarian provides personalized recommendations to improve farm biosecurity, resulting in a large volume of text data. This study aimed to develop a machine learning model capable of automatically classifying these biosecurity recommendations into 12 predefined categories. As the recommendations were written in French or English, all texts were translated into French to ensure consistency in feature extraction and model training. The model was trained on 11,250 manually classified veterinary recommendations from 3825 Québec dairy herds, collected between 2018 and 2021. Three algorithms were tested: Multinomial Naïve Bayes (MNB), Support Vector Machine (SVM), and Random Forest (RF). Performance was evaluated using precision, recall, and F1-score. The SVM achieved the highest performance while maintaining efficient processing time. The trained SVM model was selected to classify new recommendations collected between 2022 and 2024 from herds in Alberta, Ontario and Québec. To evaluate model's performance on this new dataset, a random sample of 250 recommendations was manually classified. The agreement between human classification and model predictions resulted in a Cohen's Kappa of 0.88, suggesting strong agreement. This study highlights the potential of machine learning to classify biosecurity recommendations and support timely, informed decision-making in dairy herd management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,644
Score d'incertitude au seuil0,599

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle