Genomic Relationship Between Brochothrix campestris and Its Phages: A Cross-Replicon and Interspecies Perspective
Notice bibliographique
Résumé
Background/Objectives: The bacterium Brochothrix campestris is closely related to Brochothrix thermosphacta, a known food spoilage agent, and Listeria monocytogenes, the causative agent of listeriosis. B. campestris garnered attention several years ago because it produces brochocin-C, a bacteriocin capable of inhibiting the growth of certain pathogens. It has been recently suggested that phages play a significant role in the evolution of B. thermosphacta, similar to the role they play for L. monocytogenes. However, understanding the role of phages in the evolution of B. campestris has been challenging because only a draft of genome sequences of a single B. campestris strain was previously available. Methods: In this study, DNA from the B. campestris type strain DSM 4712 was sequenced using Oxford Nanopore and Illumina technologies to obtain complete, high-quality genome sequences. Results: The assembly revealed the presence of a plasmid and a phage-plasmid. Additionally, chromosomal analysis identified several genomic islands, including one harboring the brochocin genes, suggesting that these genes may have undergone horizontal transfer. Conclusions: This study underscores the potential importance of phages in the evolution of B. campestris, and also highlights the need for further research into the interactions between Brochothrix species and their associated phages to better understand these complex biological relationships.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».