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Enregistrement W4415215411 · doi:10.1093/biomethods/bpag024

Non-contiguous Computed Tomography Lung Scans Can be Manipulated to Permit Artificial Intelligence Analyses for Interstitial Lung Disease in Systemic Sclerosis

2025· preprint· en· W4415215411 sur OpenAlexafffund
Murray Baron, Quan Dong Nguyen, Bojan Kovacina, Charmaine van Eeden, Georg Langs

Notice bibliographique

RevueBiology Methods and Protocols · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Sclerosis and Related Diseases
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMcGill University
Organismes subventionnairesBoehringer Ingelheim CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDICOMHoneycombingConcordanceIntraclass correlationData setInterstitial lung diseaseLungComputed tomography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Artificial intelligence (AI) can analyse high-resolution CT lung scans (HRCT) in various interstitial lung diseases (ILDs), including systemic sclerosis (SSc). Older HRCT lung scans may have been saved as small DICOM file sets consisting of non-contiguous slices. These are not amenable to AI analyses. Our aim was to develop and test a method of rebuilding small non-contiguous sets of HRCT lung slices into larger sets of contiguous slices that could be analysed by AI programs. We deleted sets of DICOM files from 14 large DICOM file set scans from SSc patients and were left with a scan with about 30 equidistant non-contiguous slices. We then inserted copies of scans between each pair of slices to create a large DICOM file set similar in size to the original large file set scan. Both the original scan and the rebuilt large DICOM file set scan were analysed by Contextflow ADVANCE Chest CT. We recorded the values for honeycombing (HC), reticular pattern (RP), ground glass opacities (GGO), and total ILD. We analysed agreement between the original scan and the rebuilt large DICOM file set scan using intraclass correlation coefficient (ICC), Lin’s concordance correlation coefficient (CCC), Bland–Altman limits-of-agreement (LOA) plots and the Bradley–Blackwood P-value. ICC, CCC, Bradly–Blackwood P-values and Bland–Altman plots showed excellent agreement between scans for HC, RC, GGO, and total ILD except for the Bradley–Blackwood P-value for RP. Non-contiguous HRCT small DICOM file set lung scans in SSc can be manipulated to allow analysis by AI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,204
Tête enseignante GPT0,490
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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