Contextual regulation of T follicular helper cell expansion and differentiation into T regulatory type 1 cells by multiple transcription factors
Notice bibliographique
Résumé
Differentiation of naive T cells into T helper (TH), including T follicular helper (TFH), cell subsets is regulated by subset-specific transcription factors (TFs). We examine the role of 20 TFs binding to motifs enriched in open chromatin regions of TFH cells in the TFH-to-T regulatory type 1 (TR1) cell conversion following repetitive antigen exposure. Certain TFH TFs, such as TCF-1 and TOX-2, contribute to TFH formation and function but are dispensable for TFH expansion and TR1 transdifferentiation. Eleven others, including activating TF 6 (ATF-6), BATF, BCL-6, class E basic-helix-loop-helix protein 40 (BHLHE40), BLIMP-1, ELK-4, IRF4, c-MAF, signal transducer and activator of transcription (STAT)-3, STAT-4, and T-BET, play context-specific roles at different stages of the pathway. Most of these TFs simultaneously promote and suppress different cell fate transitions along the TFH-TR1 axis and regulate subset-specific genes in a stage-specific manner. Thus, TFs with distinct TH cell reprogramming properties in naive T cells drive the acquisition of different gene expression programs along the multicellular TFH-TR1 axis, depending on each cell's transcriptional state.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».