<i>Pseudomonas</i> sp. Strain 273 Metabolizes Decanes with Poly- or Perfluorinated Carbons
Notice bibliographique
Résumé
During growth with terminally monofluorinated decanes, the soil isolate Pseudomonas sp. strain 273 releases inorganic fluoride and channels fluorometabolites into glycerophospholipid biosynthesis. We explored the ability of this bacterium to metabolize 1,1-difluorodecane (F2-decane), 1,1,1-trifluorodecane (F3-decane), and 1,1,1,2,2-pentafluorodecane (F5-decane) to assess the impacts of increasing degree of fluorination on organismal metabolism. Growth occurred with all three polyfluorodecane substrates, and inorganic fluoride release was observed in cultures amended with F2-decane and F5-decane but not with F3-decane. Fluorine nuclear magnetic resonance spectroscopy ( 19 F NMR) detected polyfluorinated C 6 and C 4 short-chain fatty acid catabolites suggesting incomplete β-oxidation during catabolism by strain 273. Gas chromatography–mass spectrometry (GC-MS) analysis corroborated the formation of terminally poly- or perfluorinated short-chain fatty acids. Ultrahigh performance liquid chromatography-high resolution mass spectrometry (UHPLC-HRMS) based global lipidome profiling revealed glycerophospholipids with fluorine substitutions at the sn1/sn2 acyl chains and identified a range of glycerophospholipids that contained between two and ten fluorines depending on the growth substrate. These findings advance our understanding of bacterial transformation of alkanes with poly- and perfluorinated carbons and highlight the formation of short-chain fluorinated fatty acids as catabloc products and fluorophospholipids as anabolic products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».