Glacial History and Landscape Features Shape the Hierarchical Population Genetic Structure of Woodland Caribou ( <i>Rangifer tarandus caribou</i> ) in Western Canada
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Characterising hierarchical population structure is crucial to understanding a species' evolutionary history and informing effective conservation and management strategies. Many terrestrial species in North America have experienced a wide range of evolutionary pressures at multiple scales, ranging from large‐scale range shifts and recolonisations driven by glacial cycles to more localized contemporary habitat degradation and fragmentation. Hence in this region, given the multi‐level evolutionary forces at play, genetic variation and diversity are often hierarchically structured. We analysed genomic diversity and variation in woodland caribou ( Rangifer tarandus caribou ) across western Canada using genotypes from ~33,000 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) loci from 759 geo‐referenced individuals spanning 45 pre‐defined subpopulations. We employed genetic clustering methods and measures of genetic differentiation to characterise hierarchical population structure in the region and tested for latitudinal changes in heterozygosity resulting from post‐glacial recolonisation and hybridisation. Our results confirm that woodland caribou genetic diversity and differentiation occur at multiple hierarchical levels, reflecting post‐glacial recolonisation patterns and landscape heterogeneity. Notably, the major genetic clusters identified in our study do not align with current recognised units for the species in this region. We also observe elevated heterozygosity in the mid‐latitudes of the sampled range, indicative of hybridisation following secondary contact during post‐glacial recolonisation. These findings underscore the need to consider and include genetic diversity at all hierarchical levels in conservation planning, as wide‐ranging species often experience diverse and complex evolutionary histories and pressures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».