MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4415285787 · doi:10.1126/sciadv.adw1410

Bacterial communities co-develop with respiratory immunity early in life, linking dysbiosis to systemic monocyte signature and wheezing

2025· article· en· W4415285787 sur OpenAlexfundno aff
Céline Pattaroni, Matthew Macowan, Roxanne Chatzis, Giuseppe Iacono, Bailey Cardwell, Mindy Gore, Adnan Čustović, Michael D. Shields, Ultan F. Power, Jonathan Grigg, Graham Roberts, Peter Ghazal, Jürgen Schwarze, Steve Turner, Andrew Bush, Sejal Saglani, Clare M. Lloyd, Benjamin J. Marsland

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesQueen's University BelfastQueen's UniversityWellcome Trust
Mots-clésImmune systemDysbiosisAcquired immune systemImmunityRespiratory systemGeneGene expressionAirwayColonization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early microbial colonization influences respiratory disease risk, yet mechanisms remain unclear. In a prospective birth cohort of 256 infants, we profiled bacterial, fungal, and viral communities in the upper airway and assessed local immune gene expression longitudinally and systemic gene expression at 1 year. Bacterial populations, not fungal or viral, correlated most strongly with immune development during the first 3 months, coinciding with composition shifts and immune-related gene expression changes, including interferon and adaptive immunity pathways. In contrast, the mycobiome and resident viruses showed no significant coevolution with host immunity. By 1 year, infants who previously wheezed displayed an upper airway microbiota enriched in Haemophilus influenzae and Moraxella , accompanied by a distinct local and systemic immune gene signature featuring elevated classical monocyte-related genes. These findings reveal a specific link between early-life bacterial dysbiosis, monocyte-related immunity, and wheezing onset, suggesting potential targets for early intervention in respiratory disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScience AdvancesMême sujetGut microbiota and healthTravaux en français237 207