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Enregistrement W4415287123 · doi:10.1101/2025.10.17.683092

Computational modelling of functional maturation of primary motoneuron firing properties in developing zebrafish

2025· preprint· W4415287123 sur OpenAlexafffund
Stephanie F. Gaudreau, Tuan V. Bui

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésZebrafishCalciumElectrophysiologyPrimary culturePotassium channelPrimary (astronomy)Primary motor cortexPotassiumMotor neuron

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Several ion currents of zebrafish primary motoneurons undergo changes in expression level during early development. Similarly, the firing properties of primary motoneurons and their involvement during locomotor activity change during early development as locomotor control of developing zebrafish matures. To test whether the experimentally observed changes in ion currents during development could underlie changes in firing properties and in participation during locomotor activity, we created models of primary motoneurons at developmental stages. Changes in the expression levels of a persistent outward potassium current, persistent inward potassium current, and several high-voltage activated calcium currents were modelled based on experimental observations. Simulations of our computational models replicated shifts in primary motoneuron firing properties and involvement during light-evoked swimming observed at 3 and 5 days post-fertilization. Our results suggest that developmental changes in specific ion currents of primary motoneurons could be sufficient to foster changes in firing properties of primary motoneurons that shape their activity level during maturation of motor control in developing zebrafish. Key points Developmental changes in persistent inward and outward currents could explain changes in firing properties of primary motoneurons in larval zebrafish Modelling suggests these currents are sufficient to explain differences in primary motoneuron firing during light-evoked swimming responses at two developmental stages Developmental changes in high-voltage activated calcium currents explain differences in appearance of persistent inward currents during voltage-clamp ramp Interaction between high-voltage activated calcium currents and calcium-dependent potassium currents could explain why blocking calcium currents increases primary motoneuron firing

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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