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Enregistrement W4415288871 · doi:10.1101/2025.10.16.682971

Lectin Microarray-based Glycomics and Machine Learning Identify Shared Osteoarthritis Biomarkers in Humans, Dogs, and Horses

2025· preprint· en· W4415288871 sur OpenAlexaff
Parisa Raeisimakiani, Kei Hayashi, Lara K. Mahal, Heidi L. Reesink

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWeill Cornell Medical CollegeNational Institutes of HealthHarry M. Zweig Memorial Fund for Equine Research
Mots-clésGlycomicsGlycanOsteoarthritisLectinGlycosylationMicroarrayGlycomeDNA microarrayMicroarray analysis techniques

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Post-traumatic osteoarthritis (PTOA) is a common sequela to joint injury in both humans and companion animal species such as horses and dogs. Despite the increasing prevalence of osteoarthritis (OA) in humans, investigation of glycosylation changes associated with OA remains in its infancy. Recent advances, such as lectin microarray analysis, now enable detailed glycan profiling in complex biofluids such as synovial fluid. Using lectin microarray technology, this study characterized glycosylation patterns in synovial fluid samples from healthy and OA-affected joints in horses, dogs, and humans. Comparative glycan-binding profiles within and between species revealed conserved and distinct glycomic signatures associated with OA. Machine learning models, including classification algorithms, effectively distinguished OA from healthy joints, identifying key lectins and glycan epitopes crucial to these predictions. The identified lectin markers reflect specific glycosylation pathways and potential inflammatory mechanisms, demonstrating their value in differentiating between healthy and OA phenotypes. Our findings underscore the promise of integrated glycomic profiling and machine learning to enhance our understanding of glycan involvement in the pathogenesis of OA and to facilitate the development of diagnostic and therapeutic strategies applicable to both veterinary and human medicine. In Brief Osteoarthritis affects humans and companion animals; however, its molecular features remain unclear. Using lectin microarrays and machine learning, we identified conserved and species-specific glycan signatures in synovial fluid that differentiate between control and osteoarthritic joints. This One Health approach highlights shared molecular mechanisms of joint degeneration and establishes data-driven glycomic profiling as a framework for understanding osteoarthritis across species. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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