<i>Leishmania donovani</i> 's protein tyrosine phosphatases interact with <scp>DUF</scp> 21 and respond to environmental magnesium
Notice bibliographique
Résumé
Leishmania donovani is a causative agent of the neglected tropical disease known as visceral leishmaniasis or Kala Azar. This disease is lethal when untreated, with more than 90 000 cases annually. Little is known about magnesium regulation in these parasites despite magnesium being the second most abundant intracellular cation and universally required for normal cell function. L. donovani contains two protein tyrosine phosphatase (PTP) proteins (PTP1 and PTP2) and a DUF21 protein (domain of unknown function 21), which are respectively homologous to mammalian PRL [phosphatases of regenerating liver; also known as protein tyrosine phosphatase type IVA (PTP4A)] and mammalian transmembrane protein CNNM (cyclin M family). In mammalian cells, the PRL and CNNM multiprotein complex has been shown to sense and modulate intracellular magnesium levels. Herein, we revealed that L. donovani PTP1 and DUF21 can also form a specific protein complex. Using CRISPR-Cas9 gene editing, four L. donovani knockouts, LdΔPTP1, LdΔPTP2, a double knockout termed LdΔPTP1/2, and LdΔDUF21 have been generated. Magnesium-dependent growth curves demonstrated that the LdΔPTP1/2 mutant could not survive in low magnesium and had a reduced level of survival in infected macrophages. In contrast, LdΔDUF21 is sensitive to high levels of magnesium and has an increased level of intracellular magnesium and an increased survival in macrophages compared to wild-type L. donovani. Taken together, these observations provide evidence that, similar to the PRL and CNNM proteins in mammalian cells, PTP and DUF21 homologs in L. donovani have the ability to complex and respond to environmental changes in magnesium.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».