The gut microbiota of Indigenous populations in the context of dietary westernization: a systematic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background Indigenous populations worldwide are undergoing dietary transitions from traditional patterns toward westernized diets, influencing gut microbiota diversity and composition, with potential implications for health. Objective This systematic review and meta-analysis aimed to compare gut microbiota diversity and composition among Indigenous populations following traditional versus westernized dietary patterns. Methods A comprehensive literature search was conducted in March 2024 and updated on February 25, 2025 across databases, including All Ovid MEDLINE®, Embase, Web of Science, CAB Abstracts, and Food Science and Technology Abstracts, along with searches of gray literature sources. Eligibility criteria included observational studies comparing gut microbiota diversity and composition between traditional and westernized diets among healthy Indigenous adults (≥16 years) without chronic diseases. Two reviewers independently performed study selection, data extraction, and risk of bias assessment using the ROBINS-E tool. Data were synthesized using random effects models, specifically applying the restricted maximum likelihood estimator to calculate between-study variance (τ 2 ). Results Of 19,836 articles identified, nine studies ( N = 657 participants) met inclusion criteria. Traditional diets tended to be associated with higher microbial diversity, although results varied across diversity metrics and studies. Shannon diversity was higher in traditional groups, but this difference was not statistically significant (standardized mean differences = 0.67; 95% CI: −0.26 to 1.60; I 2 = 92.9%). Other diversity indices (Chao1, Simpson, observed species richness) did not show clear differences between diet groups. Descriptive taxonomic analyses also revealed substantial heterogeneity across populations, reflecting the context-specificity of microbiota differences between traditional and westernized groups. Nonetheless, most westernized groups exhibited a higher Firmicutes/Bacteroidetes ratio at the phylum level and a lower Prevotella / Bacteroides ratio at the genus level. Conclusion The observed heterogeneity likely reflects methodological differences, ecological variability, and the diversity of traditional diets and varying patterns of dietary transition. Longitudinal research is needed to better understand how dietary transitions affect gut microbiota over time in Indigenous populations. Systematic review registration https://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/view/CRD42024597804 .
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,013 | 0,034 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,016 | 0,024 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».