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Enregistrement W4415450211 · doi:10.1016/j.ekir.2025.09.053

Exome-Wide Analysis Identifies a Rare EXD3 Missense Variant Associated With Diabetic Kidney Disease

2025· article· en· W4415450211 sur OpenAlexafffund
Niina Sandholm, Joanne B. Cole, Viji Nair, Eoin Brennan, Elena Giardini, Jani K. Haukka, Eunji Ha, Anna Syreeni, Rany M. Salem, Damian Fermin, Josep V. Mercader, Laura J. Smyth, Claire Hill, Josyf C. Mychaleckyj, Stuart J. McGurnaghan, Rachel G. Miller, Tina Costacou, Barbara E.K. Klein, Janet K. Snell‐Bergeon, Andrew D. Paterson, Rasa Verkauskienė, Jeļizaveta Sokolovska, Nicolae Mircea Panduru, Gianpaolo Zerbini, Kerstin Brismar, Andrzej S. Krolewski, Valma Harjutsalo, Peter Rossing, Samy Hadjadj, Gareth J. McKay, Amy Jayne McKnight, Alexander P. Maxwell, Katalin Suszták, Catherine Godson, Matthias Kretzler, Joel N. Hirschhorn, José C. Florez, Per‐Henrik Groop

Notice bibliographique

RevueKidney International Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensInstitute of Nutrition, Metabolism and DiabetesSickKids Foundation
Organismes subventionnairesJDRFNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesConsiliul National al Cercetarii StiintificeGeorge M. O'Brien Michigan Kidney Translational Core CenterNational Institutes of HealthSigrid Juséliuksen SäätiöMedical Research CouncilSamfundet FolkhälsanNovo NordiskGenesis HealthCare SystemNovo Nordisk FondenUniversity of VirginiaAcademy of FinlandDepartment for the EconomyUK Research and InnovationScience Foundation IrelandFolkhälsanin TutkimussäätiöJuvenile Diabetes Research Foundation CanadaWilhelm och Else Stockmanns StiftelseHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriUniversity of Pittsburgh
Mots-clésMissense mutationDiseasePodocyteKidney diseaseDiabetic nephropathyRare disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Diabetic kidney disease (DKD) is a major complication of diabetes, with genetic factors contributing to its progression. Although genome-wide association studies (GWAS) have identified common variants, the role of low-frequency and rare coding variants remains underexplored. Methods: We performed exome-wide meta-analysis of up to 10,312 individuals with type 1 diabetes (T1D) genotyped using genome arrays with focused exome content. We included 10 DKD definitions based on albuminuria, estimated glomerular filtration rate (eGFR), or both. We analyzed nonsynonymous variants individually and used gene-level analyses for low-frequency (minor allele frequency [MAF] < 5%) and rare (< 1%) variants. Replication was performed in 10,066 participants with T1D and in UK Biobank participants with type 2 diabetes (T2D). Gene expression was assessed in cultured human podocytes. Results: = 0.014). Conclusion: in podocyte integrity and DKD pathogenesis. However, further functional investigations are necessary to understand the underlying molecular mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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