Evaluation of Polygenic Risk Scores for a Possible Genetic Basis of the Inverse Association Between Cancer and Cognitive Decline
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Accumulating evidence suggests that the incidence of cancer and dementia are inversely associated. Bias does not appear to fully account for the relationship, but causal explanations have not been adequately investigated. We thus considered a possible inverse shared genetic basis. METHODS: We constructed polygenic risk scores for cancer (PRS cancer ) and Alzheimer disease (PRS AD ) in European ancestry UK Biobank (UKB) and Health and Retirement Study (HRS) participants aged 60 years or older. Linear mixed-effects models evaluated associations of PRS cancer with cognition, and logistic regression evaluated associations of PRS AD with cancer. RESULTS: In UKB, PRS cancer was nominally associated with improved fluid intelligence ( β : 0.12, 95% CI: 0.01-0.22). Twelve variants in PRS cancer , including 7 in the human leukocyte antigen (HLA) complex, were positively associated with fluid intelligence, and 7 were inversely associated ( P <5.8×10 -5 ). PRS cancer and its contributing variants were not associated with cognitive outcomes in HRS. PRS AD was not associated with cancer risk in either study cohort. DISCUSSION: Though not conclusive, the direction of the association between PRS cancer and fluid intelligence was consistent with our a priori hypothesis that cancer risk variants would decrease cognitive decline. The association pattern with HLA-related variants suggests potential relevance of immune surveillance for the inverse association between dementia and cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».