Type I Interferon Signature Distinguishes ANCA-Associated Vasculitis Phenotypes and Predicts Kidney Prognosis
Notice bibliographique
Résumé
Background: ANCA-associated vasculitis (AAV) causes severe multisystemic organ damage. The main phenotypes, microscopic polyangiitis (MPA) and granulomatosis with polyangiitis (GPA), share similarities but differ in clinical presentation and outcome. To uncover their molecular differences, we performed transcriptomic profiling of kidney tissue, then focused on type I interferon (IFN-I) pathway activation in kidney and blood and its clinical implications. Methods: We analyzed two independent cohorts (Maine-Anjou and RENVAS registries) of 193 AAV patients with glomerulonephritis. NanoString nCounter transcriptomic profiling, qPCR, MxA immunohistochemistry, and serum inflammatory molecules quantification were conducted. Comparative analyses of MPA vs. GPA (and MPO-AAV vs. PR3-AAV) were validated using independent public datasets. Results: Kidney transcriptomics revealed significant upregulation of the IFN-I pathway in MPA/MPO-AAV compared to GPA/PR3-AAV and controls. qPCR, immunohistochemistry, and analysis of external datasets confirmed these findings. IFN-I activation correlated with increased kidney fibrosis, independently of kidney function. High renal IFN-I signatures were linked to lower kidney survival, independently of kidney function and pathological scores. MPA kidneys also exhibited higher mast cell and T cell infiltration. Systemic analyses showed elevated IFNα and interferon-related inflammatory molecules in AAV, driven by a stronger IFN-I gene signature in MPA. Conclusion: This study identifies a distinct IFN-I signature in MPA/MPO-AAV, underscoring its potential role in AAV heterogeneity and kidney pathology. IFN-I emerges as a potential prognostic biomarker and therapeutic target in AAV, particularly for MPA. Further studies are needed to clarify its mechanisms and explore IFN-I modulation in clinical trials.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».