MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4415474476 · doi:10.1681/asn.2025wwgmvrgc

Collagen Type IV Alpha-1 (Col4a1) Is Necessary for Glomerular Repair Through Pax2 Regulation

2025· article· en· W4415474476 sur OpenAlexaff
Joanna Cunanan, Nicholas Maksimowski, Dongke Zhang, V Gregorio, Samantha Ricardo, Emine Bilge Çaparali, Rohan John, Ana Konvalinka, Moumita Barua

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRenal glomerulusKidneyKidney diseaseType IV collagenKidney Glomerulus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Podocyte loss in glomerular disease is challenging to treat due to their terminal differentiation. Glomerular parietal epithelial cells (PECs) express developmental markers like the transcription factor PAX2. Our previous work suggests that Pax2 mutant (Pax2A220G/+) mice exhibit impaired PEC-mediated podocyte regeneration. Here, we investigate the molecular mechanisms underlying this deficient repair. Methods: Glomeruli from Pax2A220G/+ and wildtype mice, at baseline and after Adriamycin-induced injury, were analyzed using mass spectrometry proteomics. Results: While wildtype mice recovered from injury, Pax2A220G/+ mice developed persistent albuminuria and podocyte foot process effacement (Fig-1A). To explore molecular drivers of repair, we analyzed an external glomerular single-cell RNA-sequencing dataset from Adriamycin-injured wildtype mice, identifying 40 top-ranked ligand-receptor pairs involved in glomerular repair. Of these, only collagen type IV alpha-1 (COL4A1) was differentially expressed in Pax2A220G/+ versus wildtype glomeruli after injury in our proteomics data. The Col4a1 gene is also a predicted PAX2 target for expression, determined through bioinformatics-based analysis of known transcription factor binding site motifs (Fig-1B). COL4A1 expression was reduced in Pax2A220G/+ mice post-injury, validated by capillary gel electrophoresis and immunohistochemistry. A luciferase assay in HEK293 cells transfected with mutant Pax2 (corresponding to the same mutation in Pax2A220G/+ mice) showed lack of COL4A1 activation (Fig-1C). Conclusion: Studies show COL4A1 contributes a flexible matrix during kidney development and this may be harnessed in glomerular repair. Our data suggests reduced PAX2-mediated Col4a1 transcription in the glomerulus leads to deficient COL4A1 expression, associated with abnormal repair, exacerbated podocyte loss, and worsened disease in Pax2A220G/+ mice (Fig-1D).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of Nephrology→Même sujetCell Adhesion Molecules Research→Travaux en français237 207→