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Enregistrement W4415559713 · doi:10.1101/2025.10.25.684473

Utility of alternate stable isotope calibration equations and informative priors when estimating the breeding origin of Arctic-breeding shorebirds

2025· preprint· W4415559713 sur OpenAlexaffabout
Devin R. de Zwaan, Julie Paquet, Rebeca C. Linhart, Erica Nol, Paul A. Smith, Diana J. Hamilton

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAvian ecology and behavior
Établissements canadiensMount Allison UniversityTrent UniversityEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrior probabilityCalibrationArcticFeatherStable isotope ratioBayesian probability

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Understanding migratory connectivity is essential for monitoring and conserving Arctic-breeding shorebirds, particularly given divergent rates of decline across populations. Stable hydrogen isotope analysis of feathers offers a scalable, non-invasive method to assign breeding origin, but current applications are limited by the absence of shorebird-specific calibration equations, which associate feather isotope values with environmental isotope gradients (“isoscapes”), and by longitudinal isoscape bands in the Arctic that result in diffuse origin estimates across broad, heterogeneous regions. We evaluated the utility of alternate calibration equations and the incorporation of occupancy-based informative priors for improving breeding origin assignments. Specifically, we analyzed feather isotope data from hatch-year semipalmated sandpipers ( Calidris pusilla ) captured at staging sites in the Canadian Maritimes, as well as known-origin Arctic samples, to compare calibration equations from different reference datasets and test priors derived from eBird habitat occupancy predictions. We demonstrate that Arctic samples of known origin largely align with calibration equations based on broad passerine datasets, although incorporating Arctic samples into the calibration may correct for a marginal westward bias in origin estimates. Using occupancy-based priors that reflect habitat preferences increased precision by 18.8%, identifying ‘hotspots’ within otherwise expansive isotopic bands. We highlight the validity of existing reference datasets with broad geographic coverage and demonstrate the value of informative priors to refine origin estimates. We recommend expanding Arctic sample collections across a wider longitudinal gradient to define a shorebird-specific calibration equation and further exploring potential biases in prior data sources to improve accuracy of Arctic-breeding shorebird origin assignments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,072
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,125

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,072
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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