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Enregistrement W4415594897 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-4mnvf

Towards a holistic mechanistic link between source and toxicological effects using aggregate exposure pathways

2025· article· W4415594897 sur OpenAlexaff
Edmond Sanganyado

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésToolboxAdverse Outcome PathwayKey (lock)Resource (disambiguation)ScarcityBridging (networking)InteroperationStakeholder

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aggregate exposure pathway (AEP) framework, designed to map changes in chemical exposures from source to target site, has struggled to gain significant traction since its proposal a decade ago. Despite its promise, AEPs have seen limited utility, largely due to scarcity of harmonized, interoperable, holistic, and mechanistic exposure data as well as the impracticality of gaining exposure data for all commercially available chemicals. We propose a paradigm shift to revitalize the AEP by adopting Bioanalytical Equivalence Quotients (BEQs) as a universal, holistic metric. This BEQ-centric framework quantifies Key Exposure States by their integrated toxicological potential and defines Key Translation Relationships through measurable changes in BEQ (ΔBEQ), transforming them from conceptual arrows into quantifiable parameters. We detail an operational toolbox combining passive sampling for harmonized bioavailability assessment and in vitro bioassays for BEQ generation. Furthermore, we outline a strategic path forward, leveraging lessons from the successful Adverse Outcome Pathway (AOP) community—such as centralized knowledge bases and stakeholder engagement—and harnessing artificial intelligence for predictive modeling and pathway development. This integrated approach bridges the gap between external exposure and biological effect, ultimately providing a dynamic, quantitative, and actionable framework for mechanistic mixture risk assessment in the exposome era.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,007
Science ouverte0,0020,006
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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