Subzero cell division, respiration, and genomic traits of cryophilic Arthrobacter agilis Ant-EH-1 isolated from cold-arid Antarctic mineral soils
Notice bibliographique
Résumé
Arthrobacter are commonly isolated from cold soil environments globally, including those that regularly reach sub-freezing temperatures, suggesting that Arthrobacter have significant potential for growth and activity under temperature and stress extremes. Arthrobacter agilis strain Ant-EH-1 was isolated from nutrient-poor, cold-arid mineral soils from Elephant Head, Antarctica and its growth and activity at sub-freezing temperatures were characterized in this study. We observed different optimal temperatures for cell division compared with aerobic heterotrophic respiration in A. agilis Ant-EH-1. Cell division was observed from at least −5 °C to 30 °C, with the optimal (fastest) growth rate occurring at 25 °C. Microbial respiration was measured from −5 °C to 30 °C with optimal (maximum CO 2 produced) respiration occurring at 5 °C. Cold temperature optima of respiration compared with cell division could be indicative of adaptation to the cold and oligotrophic conditions of Elephant Head, where increased cell division under in situ conditions could lead to competition within the nutrient-poor soil matrix. The genome of A. agilis Ant-EH-1 was consistent with observations of cold-adapted activity and included genes related to cold stress, osmotic and oxidative stress, pigment biosynthesis, and potential scavenging of components from necromass. Microscopy revealed morphological differences in this isolate at sub-freezing temperatures, likely due to membrane or lipid modifications. Currently there are a limited number of organisms in culture that are capable of sub-zero growth, so characterisation of the growth and activity of subfreezing adapted microbiota is critical for understanding the ecology of Earth’s cryosphere, has broad biotechnological potential, and can also give insight into the limits for life on our planet or the potential for life on other cold planetary bodies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».