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Enregistrement W4415620383 · doi:10.1038/s41598-025-21455-y

Novel and less invasive biomarker assays to measure liver ATP7B in Wilson disease patients

2025· article· en· W4415620383 sur OpenAlexaff
Kimberly Amburgey, Danie La, Brodie Fischbacher, Erle M. Holgersen, Lucienne Ronco, Adam J. Gehring, Jordan J. Feld, Kahlin Cheung-Ong

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto Liver CentreToronto General HospitalOntario Genomics
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExosomeBiomarkerBiopsyLiver biopsyMessenger RNADiseaseReal-time polymerase chain reactionClinical trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Novel therapies for Wilson disease (WD) will require appropriate biomarkers and clinically relevant endpoints to demonstrate therapeutic efficacy. We aimed to develop robust, minimally invasive biomarker assays to assess target engagement in future clinical trials for WD therapeutics. We conducted a single-center, sample collection biomarker study in 21 patients with WD and 6 control participants. Serum, liver fine needle aspiration biopsy (FNA), and liver core needle biopsy (CNB) samples were collected from participants. RNA and protein were isolated from serum exosome and biopsy samples. Samples were analyzed for mRNA expression by quantitative PCR and for protein expression by a novel electrochemiluminescence (ECL) immunoassay. ATP7B mRNA was detectable in FNA, CNB, and serum exosome samples. However, serum exosomes are not yet a viable method for ATP7B quantification. ATP7B protein was only detectable in CNB samples. We compared the FNA and CNB results for five WD patients and found mRNA expression levels to be comparable with an R2 of 0.64 with statistical significance. The methods we developed may be useful in clinical settings to quantify hepatocyte-specific expression of ATP7B for the development of novel therapeutics for Wilson disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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