Admission screening for extended-spectrum cephalosporin-resistant and carbapenem-resistant Enterobacterales colonization at a referral hospital in Botswana: A one-year period-prevalence survey, 2022–2023
Notice bibliographique
Résumé
Extended-spectrum cephalosporin-resistant Enterobacterales (ESCrE) and carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) are significant contributors to infection-related mortality in low- and middle-income countries. Colonization with ESCrE and/or CRE can precede infection and serve as a reservoir for transmission within healthcare facilities and the community.We conducted a 12-month period-prevalence study, screening patients for ESCrE and CRE upon admission to a referral tertiary hospital Emergency Department in Botswana. Rectal swabs were collected within 24 hours of hospital arrival. Colonization was identified using selective culture media and confirmed using automated susceptibility testing. Associations between ESCrE/CRE colonization, and clinical and demographic variables were analysed using univariate and multivariable logistic regression. Among 802 patients, 24.1% (n = 193) were colonized with ESCrE, and 1.5% (n = 12) with CRE. ESCrE colonization was associated with recent hospitalization (within the last six months) (aOR 1.76, 95% CI 1.11-2.79), borehole water use (aOR 3.95, 95% CI 1.12-13.87), indwelling medical devices (aOR 2.19, 95% CI 1.08-4.48), and age < 1 year (aOR 2.09, 95% CI 1.32-3.30). CRE colonization was associated with antiretroviral drug use (cOR 6.60, 95% CI 1.72-25.36). Infants (<1 year) had over three times the odds of ESCr/CR-Klebsiella spp. colonization compared to adults (cOR 3.60, 95% CI 1.82-7.13). Infant age, recent healthcare exposure, indwelling medical devices, and borehole water use were key risk factors for ESCrE colonization, highlighting the need for targeted infection prevention strategies in Botswana. The identified potential association between CRE colonization and antiretroviral drug use warrants further investigation to elucidate any possible links and drivers between HIV care and antimicrobial resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».