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Enregistrement W4415660146 · doi:10.1038/s41467-025-65315-9

Regulation of ADP-ribosyltransferase activity by ART domain dimerization in PARP15

2025· article· en· W4415660146 sur OpenAlexfundno aff
Carmen Ebenwaldner, Antonio Ginés García Saura, Simon Ekström, Katja Bernfur, M. Moche, Derek T. Logan, Michael S. Cohen, H. Schüler

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUmeå UniversitetKarolinska InstitutetIngaBritt och Arne Lundbergs ForskningsstiftelseLunds UniversitetCrafoordska StiftelsenCancerfondenScience for Life LaboratoryVetenskapsrådetUniversity of LethbridgeVINNOVASwedish Cancer FoundationSvenska Forskningsrådet FormasU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésDomain (mathematical analysis)DimerMutantSubcellular localizationMechanism (biology)TransferaseMutationProtein domainProtein structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract PARP15 is a mono-ADP-ribosyltransferase that targets an unknown set of proteins as well as RNA. Its evolutionary relationship with PARP14 suggests roles in antiviral defence; its localization to stress granules points to functions in the regulation of translation. Here we show that the transferase domain of PARP15 dimerizes in solution; the formation of dimers is a prerequisite for catalytic activity and monomeric mutant variants of the domain are inactive. In cells, dimer-disrupting mutations abrogate catalytic activity and alter the subcellular localization of the full-length protein. Using biophysical methods, including X-ray crystallography and HDX-MS, we provide evidence for a regulatory mechanism by which dimerization enables correct target engagement rather than NAD + co-substrate binding, and by which the two protomers of the dimer operate independently of one another. Together, our results uncover a regulatory mechanism in a PARP family enzyme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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