MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4415704494 · doi:10.1016/j.plaphy.2025.110714

Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster

2025· article· en· W4415704494 sur OpenAlexafffund
J. Y. Hwang, Matthew Bailey Richardson, Jonathan Kirshner, Jun Guo, Jacob Owen Perley, Victor A. Albert, Ghislain Deslongchamps, Yang Qu

Notice bibliographique

RevuePlant Physiology and Biochemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBerberine and alkaloids research
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlliance de recherche numérique du CanadaNew Brunswick Innovation FoundationNational Science Foundation
Mots-clésGene clusterAcetylationHeterologous expressionAcetyltransferasesAcetyltransferaseBiosynthesisGeneAcyltransferasesEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Monoterpenoid indole alkaloids (MIAs) constitute one of the largest and most structurally diverse classes of alkaloids found in nature, with significant pharmacological applications. While significant discoveries have been made in MIA biosynthesis, substantial gaps remain in our understanding of biosynthetic compartmentalization and the evolution of MIA biosynthesis. In this study, we identify and characterize the yohimban O -acetyltransferase (YAT), a BAHD-type acyltransferase tightly clustered with yohimban synthase (YOS) within the reserpine biosynthetic gene cluster (BGC) of Rauvolfi a. YAT specifically acetylates yohimbine and alloyohimbine in R. serpentina leaves, representing a previously unrecognized bifurcation in yohimban alkaloid metabolism. Notably, YAT exhibits a leaf-specific expression pattern, while other genes within the reserpine BGC are predominantly expressed in roots, mirroring alkaloid accumulation trends. Homology modeling and substrate docking experiments further elucidate YAT's active site, providing insights into substrate specificity and catalysis. Our findings establish the enzymatic basis of Rauvolfia MIA biosynthesis and offer insights into the evolutionary dynamics of acetyltransferases in shaping alkaloid diversity. This work also provides a foundation for synthetic biology strategies to engineer acetylated yohimban alkaloids in heterologous systems. • Discovery of YAT, a BAHD acetyltransferase in the Rauvolfia reserpine gene cluster • YAT specifically acetylates yohimbine and alloyohimbine • YAT’s expression is leaf specific, aligning with alkaloid accumulation pattern • Structural modeling reveals active site basis for substrate specificity • The study provides new insight into tissue-specific alkaloid biosynthesis

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant Physiology and BiochemistryMême sujetBerberine and alkaloids researchTravaux en français237 207