Disease pattern and risk factors of antimicrobial resistance in patients with pneumococcal infection in the Hong Kong population
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Antimicrobial resistance (AMR) presents significant challenges for the effective treatment of pneumococcal disease (PD), disease prevalence, and vaccine effectiveness caused by S. pneumoniae. We aimed to describe the pattern of AMR among isolates from patients with PD reported in the Hong Kong population from 2012-2021, and to explore the risk factors associated with AMR among patients hospitalized with PD compared to those with susceptible isolates. METHODS: PD-related hospitalizations were identified and grouped into invasive PD (IPD) or non-IPD patients. Electronic health records were collected to calculate the healthcare resource utilization relevant to each IPD/non-IPD patient. We compared the characteristics of patients with IPD/non-IPD caused by non-susceptible isolates (cases) and those without (controls) using a multivariable logistic regression model, looking for risk factors for AMR. RESULTS: The PD incidence trend was stable from 2012 to 2019 with a sudden decrease in 2020, coinciding with the beginning of the COVID-19 pandemic. Overall, 80% of patients had S. pneumoniae non-susceptible to ≥1 antibiotic. The percentage of non-susceptibility found to tetracyclines, macrolides, penicillin, and fluoroquinolones, were 85%, 79%, 23% and 2%, respectively. Overall, 46% of the patients with serotyping results were serotype 3. Significantly increased odds of AMR infection were found among the non-IPD patients aged 2-17 years when compared to older patients (18-64 years). CONCLUSIONS: Measures to reduce non-susceptible S. pneumoniae infections should focus on children and adolescents of school age. Despite the introduction of PCV13 in 2011, serotype 3 and AMR continued to threaten people in the community. Serotype 3-infected patients accounted for nearly half of the patients with PD with serotyping results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».