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Enregistrement W4415719135 · doi:10.1101/2025.10.30.685207

Stable and assayable polymicrobial human airway model reveals complex interactions between <i>Pseudomonas aeruginosa</i> and lung commensals

2025· preprint· W4415719135 sur OpenAlexafffund
Sarah Spencer, Karla N. Valenzuela‐Valderas, Brendan M. Leung

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCommensalismLungEpitheliumCytotoxicityCrosstalkCellAirwayMediatorCytokineRespiratory epithelium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Polymicrobial-host crosstalk shapes airway barrier integrity and inflammation, yet standard in vitro systems rarely sustain interaction-dependent phenotypes. We engineered an aqueous two-phase system (ATPS) confined bronchial co-culture that stabilized day-scale assays while maintaining epithelial function. A 16HBE14o-/HUVEC cell insert model was challenged with Pseudomonas aeruginosa PA01, Streptococcus pneumoniae D39, and the commensals Rothia mucilaginosa and Lactobacillus casei in mono- and polymicrobial combinations. We evaluated epithelium permeability to FITC-dextran, cell junction integrity, bacterial-induced cytotoxicity, IL-6 and IL-8 release and bacterial viability. ATPS preserved a workable assay window and bacterial confinement over 24h. PA01 disrupted barrier integrity, and commensals mitigated this pathogenic effect, whereas PA01 co-cultured with S. pneumoniae exhibited synergistic damage effects on the lung epithelium. Junctional imaging corroborated functional readouts, and cytotoxicity remained low across conditions. Cytokine shifts were condition-specific but modest, demonstrating compatibility for soluble mediator profiling. We generated a human airway-microbiome model in which ATPS confinement enabled modelling of dynamic lung-microbiome interactions, reproducing known P. aeruginosa pathogenic effects and commensal protection of the epithelium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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