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Enregistrement W4415731737 · doi:10.1038/s43856-026-01558-x

Interpretable Multiple Instance Learning for Hematologic Diagnosis from Peripheral Blood Smears

2025· preprint· en· W4415731737 sur OpenAlexaff
Siddharth Singi, Shenghuan Sun, Zhanghan Yin, R. C. GUPTA, Dylan C. Webb, Khawaja Hasan Bilal, Deepika Dilip, Linlin Wang, Neeraj Kumar, Nicholas Sanchez, Jacob Cleaves, B. M. FRIED, Ethan Yan, Ali Kamali, Argho Sarkar, Allyne Manzo, Jeeyeon Baik, Irem Isgor, Cesar Colorado-Jimenez, Anthony B. Cardillo, Leonardo Boiocchi, Aijazuddin Syed, David Kim, Brie Kezlarian-Sachs, Maly Fenelus, Alexander Chan, Mariko Yabe, Samuel I. McCash, Menglei Zhu, Simon Mantha, Orly Ardon, Lauren McVoy, Wenbin Xiao, Mikhail Roshal, Oscar Lin, Ahmet Doǧan, Iain Carmichael, Chad Vanderbilt, Gregory M. Goldgof

Notice bibliographique

RevueCommunications Medicine · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueDigital Imaging for Blood Diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthMemorial Sloan-Kettering Cancer Center
Mots-clésInterpretabilityEncoderPattern recognition (psychology)Feature (linguistics)Function (biology)Pipeline (software)Softmax functionPeripheral blood

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accurate diagnosis of hematologic malignancies from peripheral blood smears (PBSs) requires integrating cellular morphology and composition across hundreds of white blood cells. Existing approaches primarily automate single-cell classification and do not provide whole-slide diagnostic predictions. We present a full network that utilizes a highly performative cell-based encoder (DeepHeme) for feature extraction paired with our weakly supervised framework using attention-based multiple instance learning (MIL) that we call CAREMIL (Cell AggRegation, Explainable, Multiple Instance Learning). Upon evaluating various popular image encoders and MIL architectures, the combination of DeepHeme and CAREMIL is the best performing pipeline on our disease classification task. CAREMIL proves to be a robust aggregation function that outperforms the most commonly used slide level aggregation function (gated multiple instance learning) across several encoder types. The greatest improvements in performance gain with CAREMIL is observed when using out-of-domain encoders, including an encoder trained on ImageNet and leading open-source pathology foundational models (UNI2 and Virchow2). CAREMIL plus DeepHeme achieves the highest diagnostic performance across acute leukemia (AML), myelodysplastic syndromes (MDS), and hairy cell leukemia (HCL) (AUROCs 0.999, 0.891, and 0.945, respectively), and identifies AML disease even in cases with minimal or absent circulating blasts. Attention values assigned by CAREMIL highlight diagnostically relevant cells and reveal disease-specific morphometric signatures, enabling biological interpretability and case-level insight. CAREMIL remains robust to misclassified cell types by the cell image encoder and does not require explicit cell-level supervision. These findings position CAREMIL as an effective and interpretable multiple instance learning framework for hematologic slide diagnosis, with potential to extend to bone marrow aspirates, cytology, and other liquid biopsy specimens, and to support a broader shift toward quantitative, morphology-informed diagnostics in hematology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,814
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0070,006
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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