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Enregistrement W4415743089 · doi:10.3138/jammi-2025-0025

Emergence of seasonal influenza A(H3N2) variants with immune escape potential warrants enhanced molecular and epidemiological surveillance for the 2025–2026 season

2025· article· en· W4415743089 sur OpenAlexaffvenue
Suzana Sabaiduc, Samantha E Kaweski, Lea Separovic, Ruimin Gao, Charlene Ranadheera, Nathalie Bastien, Danuta M. Skowronski

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensBC Centre for Disease Control
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubcladeSeasonal influenzaAntigenic variationHemagglutinin (influenza)Cluster (spacecraft)HumNorthern HemisphereAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: All of the major antigenic changes in influenza A(H3N2) viruses since 1968 have involved mutations at just nine amino acid positions, called cluster transition sites, surrounding the receptor binding region of the hemagglutinin surface protein. During the Northern Hemisphere (NH) 2024-2025 influenza season, A(H3N2) variants emerged with multiple parallel substitutions affecting cluster transition sites 135, 145, 158, and/or 189, with implications for the 2025-2026 season. Methods: Using >24,000 global A(H3) sequences between September 2024 and August 2025, we assessed the nature and frequency of amino acid mutations among emerging NH and Southern Hemisphere (SH) A(H3N2) variants relative to the 2024-2025 subclade J and updated 2025-2026 subclade J.2 vaccine reference strains. We contextualized based on historic amino acid variation among >210,000 global A(H3) sequences since 1968 and publicly available antigenic characterization data relative to 2024-2025 and 2025-2026 vaccine reference strains. Results: Virtually all circulating A(H3N2) viruses in 2024-2025 were subclade J.2. In Europe, about one-third had cluster transition site mutations, mostly T135A with S145N. In North America, more than two-thirds had cluster transition site mutations, including T135K or S145N, with a late-season increase in doubly mutated J.2.3 (N158K + K189R) and J.2.5 (S145N + N158K) subclades. The SH 2025 season showed an increase in J.2.3 and emergence of J.2.4 (T135K + K189R), including a further drifted J.2.4.1 variant with additional N158D and other mutations, recently renamed subclade K. A substantial proportion of J.2.3 and J.2.4 viruses are antigenically distinct from the 2025-2026 influenza vaccine. Conclusion: Influenza A(H3N2) variants with a combination of cluster transition site mutations emerged during the NH 2024-2025 season. A further drifted and vaccine-mismatched variant, called subclade K, arose during the SH 2025 season and is projected to predominate among A(H3N2) viruses for the NH 2025-2026 season. While mismatched vaccines can still provide protection, enhanced genetic, antigenic, and epidemiological (eg, vaccine effectiveness, disease burden) monitoring are warranted to inform risk assessment and response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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