Generation and validation of an aryl hydrocarbon receptor knockout human embryonic stem cell line
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Glucose homeostasis is tightly controlled by hormones secreted from pancreatic islets. The most abundant cell type in islets is the β-cell, which secretes insulin in response to nutritional stimuli. We previously reported that the adverse metabolic effects of high-dose dioxin exposure in mice are regulated by the aryl hydrocarbon receptor (AHR) specifically in β-cells. Additionally, fetal exposure to low-dose dioxin reduced β-cell area in female mice at birth; however, the role of AHR in β-cell development has not been explored. To characterize the AHR pathway in developing human β-cells, we differentiated human embryonic stem cells (hESCs) into “islet-like” cell clusters (SC-islets) in vitro and treated cells with vehicle or dioxin for 24-hours at key stages of differentiation. Dioxin exposure robustly upregulated AHR gene targets ( CYP1A1, AHRR ) at all stages of differentiation but only had modest effects on markers of islet development and maturity. We next generated an AHR knock-out (KO) hESC line and found that basal CYP1A1 expression was profoundly suppressed in AHR-KO cells compared to parental cells at all stages of differentiation. Key markers of developing and mature pancreatic islets were largely unaffected by AHR deletion; however, G6PC2 was consistently downregulated in SC-islets from AHR-KO cells compared to parental cells. Interestingly, AHR-KO SC-islets also showed modestly increased insulin secretion relative to the parental line, suggesting a role for AHR in islet development. This novel AHR-KO cell line will allow for deeper investigation into the impact of AHR on development of human islets and other cell lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».