Computational and experimental investigations of oxadiazinone reactivity with cyclooctynes and other dienophiles
Notice bibliographique
Résumé
Tetrazines are heterocycles famous in bioorthogonal chemistry for their fast rates of cycloadditions with strained alkenes and alkynes. Oxadiazinones are lactone analogues of tetrazines that show potential for but have not yet been exploited in bioorthogonal use. We present computational assessment and analysis of cycloadditions of oxadiazinones to several complementary bioorthogonal alkene and alkyne handles: cyclooctyne, bicyclononyne, and trans-cyclooctene gave low transition state barriers, while the similar 8-cycle dibenzocyclooctyne did not, due to greater geometric distortion; 3- and 4-membered cycloalkenes gave intermediate values. Secondary alkyne additions to oxadiazinones and analogues following retro-Diels–Alder eliminations of N 2 from adducts of initial alkyne additions are explored, as the possible reversal of electron demand from first to second addition makes them interesting tools for selective dual-addition schemes. We also show experimental rate constants up to 0.028 mol L −1 s −1 for additions of bicyclononyne to a series of oxadiazinones.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».