MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4415755707 · doi:10.7554/elife.109131

Monocyte-endothelial interactions as a targetable node in clonal hematopoiesis-mediated cardiovascular disease

2025· preprint· W4415755707 sur OpenAlexaff
Alyssa Parker, J. Brett Heimlich, Joseph C. Van Amburg, Yash Pershad, David E. Ong, Nicole A. Mickels, Laventa M. Obare, Ketan J Hoey, Hannah K Giannini, Ayesha Ahmad, Caitlyn Vlasschaert, Tarak Nandi, Ravi Madduri, Samuel Bailin, John R. Koethe, Celestine N. Wanjalla, Alexander G. Bick

Notice bibliographique

RevueeLife · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn silicoHaematopoiesisDiseaseEndothelial stem cellMonocyteChemokineDruggabilityGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) increases risk of cardiovascular disease yet the molecular mechanisms driving this association remain incompletely understood. We hypothesized that aberrant monocyte-endothelial interactions contribute to CHIP-mediated cardiovascular disease. Methods We performed single-cell RNA sequencing on blood and peripheral vascular tissue from 4 individuals with TET2 CHIP, 6 individuals with DNMT3A CHIP, and 25 controls. We predicted interactions between monocytes and endothelial cells based on expression of ligand-receptor pairs then modeled interactions between monocytes carrying CHIP mutations with endothelial cells in vitro. We performed an in silico genomewide perturbation screen to identify genetic targets capable of mediating these interactions and then experimentally evaluated the effect of inhibiting predicted targets on monocyte-endothelial interactions in vitro. Results Expression of ligand-receptor pairs on monocytes and endothelial cells from patients with and without CHIP highlighted differences in signaling likelihood for 6 key ligand-receptor pairs related to transendothelial migration. Co-culture of monocytes with human aortic endothelial cells demonstrated that monocytes carrying CHIP mutations have decreased velocity compared to monocytes without CHIP mutations. The perturbation screen suggested 11 druggable genetic targets capable of rescuing TET2 CHIP monocytes. Experimental inhibition of ICAM1 in endothelial cells and inhibition of CXCR2 in monocytes significantly increased the velocity of TET2-mutated monocytes over endothelial cells. Conclusions CHIP mutations alter interactions between monocytes and endothelial cells. Therapeutics targeting CXCR2 and ICAM1 may restore normal interactions between monocytes and endothelial cells among patients with TET2 CHIP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeLife→Même sujetAcute Myeloid Leukemia Research→Travaux en français237 207→