A molecular map of the human spinal dorsal and ventral horn defines arrangement of neuronal types and glial sex differences
Notice bibliographique
Résumé
The spinal cord is the gateway for sensory information from the body as it ascends to the brain, as well as a major motor output center of the nervous system. It is also a key location for sensory-motor integration, and a processing site for nociceptive information that eventually drives pain perception in the brain. Tremendous progress has been made in understanding spinal cord circuits using genetic and single cell sequencing approaches in mice. Recently, several groups have conducted single-nucleus and spatial sequencing studies in postmortem human spinal cord tissue. However, the spatial properties of spinal cord cellular diversity and potential sex differences that might be important for human physiology remain unexplored. We conducted deep single-nucleus sequencing on dissected lumbar dorsal and ventral spinal cord samples from 11 organ donors, including 6 females and 5 males, and anatomically annotated spinal cord cell types with 10X Xenium single-molecule spatial transcriptomics. We identified 34 spatially and genetically defined neuron classes, many of which have clearly recognizable conserved orthologs in the rodent spinal cord. We also identified sex specific cell types and states within multiple glial types, but not neurons, demonstrating sexual dimorphism at the transcriptomic cell-type level in the adult human spinal cord. The spatial and single-nucleus atlas resulting from our work build upon previous knowledge to better understand human spinal cord physiology and to identify drug targets for neurological diseases affecting the spinal cord, in particular pain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».