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Enregistrement W4415773873 · doi:10.1002/cbic.202500674

De Novo Discovery of Bicyclic Competitive Inhibitors of Zika Virus Protease from Peptide–Bismuth Phage Display Screening

2025· article· en· W4415773873 sur OpenAlexfundno aff
Upamali Somathilake, Minghao Shang, Christoph Nitsche

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAustralian Research CouncilUniversity of Alberta
Mots-clésProteaseDibasic acidPhage displaySerineDrug discoverySerine proteasePeptideProteasesPeptide library

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

No specific vaccines or therapeutics are currently available for the prevention or treatment of Zika virus infections. The viral protease NS2B-NS3 is essential for the replication of Zika and other orthoflaviviruses, making it a target for antiviral drug development. Traditional discovery of competitive inhibitors has relied on substrate recognition sequences, typically yielding multibasic peptides. Herein, a de novo strategy is presented for identifying competitive inhibitors using peptide phage display in combination with Bi(III)-mediated in situ formation of bicyclic peptides. In an initial screening, phages displaying a library of randomized peptide-bismuth bicycles are eluted by interrupting the phage-target interactions at low pH. This approach yields a small number of peptides biased toward the active site, characterized by dibasic motifs, but only one low-ranking sequence shows modest inhibitory activity. To enhance specificity, a second screening campaign employs competitive phage elution using the dibasic boronate inhibitor CN-714 that covalently binds to the catalytically active serine residue S135 of NS2B-NS3. This strategy enriches a larger pool of competitive inhibitors sharing the characteristic dibasic substrate recognition motif. The most potent peptide-bismuth bicycle identified and synthesized features a completely novel sequence, exhibits an inhibition constant of 3.9 µM and displays remarkable proteolytic stability over 24 h.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,679

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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