Identification of Quantitative Trait Loci Contributing Partial Resistance to Canadian Isolates of <i>Aphanomyces euteiches</i> in a Pea <scp>RIL</scp> Population Derived From a New Resistance Source
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Aphanomyces root rot (ARR) caused by the soil‐borne oomycete pathogen Aphanomyces euteiches is an important concern for global pea production, ~30% of which is produced in western Canada. Host plant resistance is the primary option for management of ARR and sources of partial resistance have been identified. The objective of this research was to explore the genetic basis of ARR resistance in a new resistance source, No. 9292 (PI 195020), when challenged with two Canadian isolates of A. euteiches . A recombinant inbred line (RIL) population of 204 F 8:9 RILs derived from the crossing of partially resistant parent No. 9292 × CDC Amarillo was genotyped using an Axiom 90K SNP array and phenotyped under controlled environment conditions using a moderately (AE11) and highly virulent (AE13) A. euteiches isolate. Three quantitative trait loci (QTLs) from No. 9292 on LG1, LG3 and LG4 with logarithm of the odds (LOD) values of 5.6, 3.8 and 5.3 contributed to partial resistance against AE11. The QTLs on LG1 and LG4 co‐localised with known QTLs Ae‐Ps1.2 and Ae‐Ps4.1 , respectively. The QTL interval of Ae‐Ps4.1 was reduced from 15.4 to 10.1 cM. Ae‐Ps4.1 and Ae‐Ps2 . 4 contributed by No. 9292 and Ae‐Ps6.3 contributed by CDC Amarillo were also associated with partial resistance against isolate AE13. In the peak region of Ae‐Ps4.1 for AE13, a defence‐related peroxidase and WRKY DNA‐binding domain gene were identified. Results validated known and identified new QTLs that will contribute to the durability of resistance to ARR in pea cultivars.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».