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Enregistrement W4415774717 · doi:10.1111/ppa.70091

Identification of Quantitative Trait Loci Contributing Partial Resistance to Canadian Isolates of <i>Aphanomyces euteiches</i> in a Pea <scp>RIL</scp> Population Derived From a New Resistance Source

2025· article· en· W4415774717 sur OpenAlexafffundabout
Krishna Kishore Gali, Nimllash T. Sivachandra Kumar, Thomas D. Warkentin, Sabine Banniza

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésQuantitative trait locusPopulationResistance (ecology)Inbred strainOomyceteGenetic markerPhakopsora pachyrhiziGenetic analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Aphanomyces root rot (ARR) caused by the soil‐borne oomycete pathogen Aphanomyces euteiches is an important concern for global pea production, ~30% of which is produced in western Canada. Host plant resistance is the primary option for management of ARR and sources of partial resistance have been identified. The objective of this research was to explore the genetic basis of ARR resistance in a new resistance source, No. 9292 (PI 195020), when challenged with two Canadian isolates of A. euteiches . A recombinant inbred line (RIL) population of 204 F 8:9 RILs derived from the crossing of partially resistant parent No. 9292 × CDC Amarillo was genotyped using an Axiom 90K SNP array and phenotyped under controlled environment conditions using a moderately (AE11) and highly virulent (AE13) A. euteiches isolate. Three quantitative trait loci (QTLs) from No. 9292 on LG1, LG3 and LG4 with logarithm of the odds (LOD) values of 5.6, 3.8 and 5.3 contributed to partial resistance against AE11. The QTLs on LG1 and LG4 co‐localised with known QTLs Ae‐Ps1.2 and Ae‐Ps4.1 , respectively. The QTL interval of Ae‐Ps4.1 was reduced from 15.4 to 10.1 cM. Ae‐Ps4.1 and Ae‐Ps2 . 4 contributed by No. 9292 and Ae‐Ps6.3 contributed by CDC Amarillo were also associated with partial resistance against isolate AE13. In the peak region of Ae‐Ps4.1 for AE13, a defence‐related peroxidase and WRKY DNA‐binding domain gene were identified. Results validated known and identified new QTLs that will contribute to the durability of resistance to ARR in pea cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,764
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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