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Enregistrement W4415854764 · doi:10.3390/v17111472

Kinetics of Viral Genome Distribution in Swine Peripheral Lymphoid Organs Following Oronasal Infection with Attenuated African swine fever virus strains

2025· article· en· W4415854764 sur OpenAlexafffund
Kalhari Goonewardene, Carissa Embury‐Hyatt, Estella Moffat, Aruna Ambagala

Notice bibliographique

RevueViruses · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Disease Management and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of CalgaryUniversity of SaskatchewanCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesCanadian Food Inspection AgencyNational Pork Board
Mots-clésAfrican swine fever virusSpleenVirulenceVirusLymphatic systemGenomeLymph nodeLymph

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

African swine fever (ASF) continues to spread across the globe, causing a severe impact on the swine industry. Passive surveillance based on testing dead pigs is one of the most effective methods for early detection of ASF incursions. We have previously shown that the superficial inguinal lymph node (SILN) is a convenient and effective sample type for ASF virus (ASFV) genome detection in pigs succumbed to highly or moderately virulent ASFV infections. In this study, we explored the distribution kinetics of ASFV into SILN and other lymphoid tissues in pigs exposed to moderately virulent ASFV strains (ASFV Estonia 2014 and ASFV Malta'78), oronasally. The ASFV genome was detected in SILNs as early as 2-3 days post-infection (dpi), peaking around 5-9 dpi. The detection of ASFV Estonia 2014 started early, and the pigs succumbed to infection faster compared to the ASFV Malta'78 infected pigs that remained longer. All pigs that succumbed to ASF had comparable levels of ASFV genomic material in the spleen and SILNs. The levels of ASFV genomic material gradually started to decrease in pigs that did not succumb to ASF, indicating possible virus clearance. In contrast, ASFV genome levels in blood and spleen samples remained relatively steady during the study period. Immunohistochemistry and in situ hybridization of spleen and SILN samples supported real-time PCR results. This study demonstrates the distribution kinetics of moderately virulent ASFV in peripheral lymph nodes and highlights the utility of SILNs for dead pig screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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