Blood metabolites mediate gut microbiota effects on depression: A Mendelian randomization study
Notice bibliographique
Résumé
Accumulating evidence indicates that gut microbiota (GM) influence depression via gut-brain axis signaling, yet the causal relationships and underlying mechanisms are not fully understood. We conducted bidirectional Mendelian randomization (MR) to assess GM-Depression causal effects, with additional analyses examining blood metabolite mediation. We conducted a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis using genetic instruments for gut microbiota (GM) from the FINRISK 2002 cohort ( n = 5959). Depression data were obtained from the FinnGen R11 database ( n = 448,069, European ancestry), along with three additional independent datasets: Pan-UK Biobank ( n = 370,457), Jamapsy_Giannakopoulou ( n = 194,548), and PGC-noUKBB ( n = 688,808). A Mendelian randomization meta-analysis was performed combining these datasets. Mediation analysis was conducted using multivariable MR (MVMR) with blood metabolite data from the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA, n = 8299). Pathway analysis was performed using MetaboAnalyst 5.0. Our bidirectional MR identified Bifidobacteriaceae as a protective factor against depression (IVW OR = 0.93, 95 % CI: 0.89–0.97, P < 0.001), confirmed by meta-analysis (β = −0.05, P = 0.002). The protection was mediated by metabolites (e.g., glycolithocholate sulfate; OR = 0.80, 95 % CI: 0.71–0.90) enriched in BCAA pathways (FDR = 0.013). Conversely, N egativibacillus sp000435195 showed nominal risk effects in IVW (OR = 1.09, 95 % CI: 1.04–1.15, P < 0.001), though meta-analysis did not support this ( P > 0.05; I 2 = 68.5 %). Its potential risk involved metabolites (e.g., sulfated piperine; OR = 1.27, 95 %CI:1.13–1.42) enriched in glycine/serine/threonine pathways (FDR = 0.002). Reverse MR excluded reverse causation (all P > 0.05). Our findings provide genetic evidence for the causal involvement of specific GM in Depression, mediated by distinct metabolic pathways, suggesting potential microbiota-based interventions for Depression treatment. • Bifidobacteriaceae reduce the risk of depression via branched-chain amino acid (BCAA) metabolism. • Negativibacillus raises depression risk by disrupting glycine, serine, and threonine metabolism. • Mendelian randomization minimizes confounding in microbiota-depression research. • Probiotic-dietary interventions may present a new therapeutic intervention for depression
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,023 | 0,043 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».