Enregistrement W4415927607 · doi:10.1038/s41564-025-02212-3

Author Correction: A roadmap for equitable reuse of public microbiome data

2025· article· en· W4415927607 sur OpenAlexaff

Laura A. Hug, Roland Hatzenpichler, Cristina Moraru, André Soares, Folker Meyer, Anke Heyder, Rabab Mahmoud Abdallah, A. Abdalrahem, Nafi’u Abdulkadir, Ibukun M. Adesiyan, L. Alteio, Karthik Anantharaman, R. Anderson, A. H. Andrei, J. Antonio Baeza, Frederik Bak, Brett J. Baker, Alexander Bartholomäus, Nicolás Bejerman, Jennifer F. Biddle, Andrew Bissett, J. Blakeley-Ruiz, K. A. Block, Joachim Boldt, Germán Bonilla‐Rosso, Till L. V. Bornemann, Verena S. Brauer, William J. Brazelton, Andreas Bremges, Elena Buelow, Zachary M. Burcham, Annabel Cansdale, J. Gregory Caporaso, Tomislav Cernava, Ioanna Chatzigiannidou, Rodrigo Costa, Cameron R. Currie, Anne Daebeler, V. De Anda, Ana de Santiago, Luísa Mayumi Arake de Tacca, Justine W. Debelius, Simon M. Dittami, Xu Dong, Mária Džunková, Arwyn Edwards, Robert A. Edwards, Susan Egbert, Julia C. Engelmann, Thijs J. G. Ettema, Cassandra L. Ettinger, Aleksandra Petrović Fabijan, Rebecca Ferguson, Patrizia Ferretti, Pierre Foucault, Jed A. Fuhrman, Andreas Gada, Patricia Geesink, Isabel Rodrigues Gerhardt, Mark O. Gessner, Donato Giovannelli, David I. Gittins, Gregory B. Gloor, Raúl A. González‐Pech, Chandana Gopalakrishnappa, Chris Greening, Rachel Gregor, Ann Gregory, Hans‐Peter Grossart, Mathieu Groussin, Bruno V. Guerrero, Mustafa Güzel, Natsuko Hamamura, Trinity L. Hamilton, Jon Hamm, Luke Hart, Christiane Hassenrück, Melanie Hay, Robert M. Hechler, Patrick Hellwig, Michael A. Henson, Michael Herold, Poppy Hesketh-Best, Matthias Hess, Luke S. Hillary, Thomas C. A. Hitch, Sai Suresh Hivarkar, Katharina J. Hoff, Erik Hom, Shengwei Hou, Luisa W. Hugerth, Yeongwoo Hwang, Nicholas E. Ilott, Zackary J. Jay, Sean P. Jungbluth, Elham Karimi, Y. M. Kaspareit, Ciara Keating, Matthew Kellom, E. Anders Kiledal, Ingeborg J. Klarenberg, Robert J. Knight, Angela Koech, Eugene V. Koonin, Konstantinos Ar. Kormas, Katharina Kujala, Nikos C. Kyrpides, Sabina Leanti La Rosa, Cédric C. Laczny, Kevin K. Lahmers, Xianyong Lan, A. A. Lateef, S. H. Lau, Florian Leese, María Ángeles Lezcano, S. S. Li, Rayane Nunes Lima, Sebastian Lücker, Alexander Mahnert, Sina Majidian, Lukas Malfertheiner, Andrew J. Marshall, Sean Meaden, Conor J. Meehan, Dimitri V. Meier, Chrats Melkonian, Daniel R. Mende, Julie L. Meyer, Grégoire Michoud, Vladimir Mikryukov, Samuel Miravet‐Verde, Jan Muschiol, Muhammad Kabiru Nata’ala, Josh D. Neufeld, Sigrid Neuhauser, Olayinka Osuolale, Jay Osvatic, Katherine M. Pappas, Daniel Parks, Renate Parry, P. V. Pascoal, Christina Pavloudi, Brent Peyton, Julia Plewka, Mathilde Poyet, Taylor Priest, E. K. Quaye, Thomas Rattei, Philipp Rausch, Elíbio Rech, Christian Rinke, Carol Robinson, Alejandro Rodríguez-Gijón, Luis M. Rodriguez‐R, Robin R. Rohwer, Tim Roloff, Jennifer Rothman, Sonja Rückert, S. Emil Ruff, Jasmine Saini, Michel Geovanni Santiago‐Martínez, Luciana F. Santoferrara, Mohamed S. Sarhan, Jimmy H. Saw, Tomasa Sbaffi, Ralf B. Schäfer, George A. Schaible, Michael Schloter, Ruth A. Schmitz, Carsten J. Schubert, Oliver Schwengers, Luděk Sehnal, A. Chandrasekar, Jegan Sekar, Mitiku Mihiret Seyoum, Manesh Shah, Itai Sharon, Bettina Siebers, Ella T. Sieradzki, Dimitrios Skliros, Oona Snoeyenbos-West, Adam Sorbie, Daan R. Speth, C. Grace Sprehn, Pranay Srivastava, Tom L. Stach, Jason Stajich, Jeffrey R. Starke, Andrew D. Steen, Richard Stöckl, T. Stoikidou, Nejc Stopnišek, Rohan Sukumaran, Bernd Sures, Shino Suzuki, Daniel Tamarit, Patrick H. Thieringer, R. Y. Tito, Chetan Trivedi, Gareth Trubl, Jaak Truu, Myrto Tsiknia, Juan A. Ugalde, Luis E. Valentin-Alvarado, Xabier Vázquez-Campos, Julia Vierheilig, F. A. Bastiaan von Meijenfeldt, Michael Wagner, Calum J. Walsh, Shuqiang Wang, Yue Wang, Carl‐Eric Wegner, Tiffany L. Weir, L. Weiss, JL Weissman, Antje Wichels, Candace L. Williams, Travis Williams, Alexandra Z. Worden, Tanja Woyke, Mengxiong Wu, Wei Xiu, Ying Zhang, Jun Zhu, Ryan Ziels, Benjamin Zwirzitz, Alexander J. Probst

Notice bibliographique

RevueNature Microbiology · 2025

Typearticle

Langueen

DomaineComputer Science

ThématiqueResearch Data Management Practices

Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of CalgaryWestern UniversityUniversity of TorontoMcMaster UniversityUniversity of Waterloo

Organismes subventionnairesnon disponible

Mots-clésParagraphConfidentialityReuseMicrobiomeHuman immunodeficiency virus (HIV)Public involvementPublic health

DOI10.1038/s41564-025-02212-3

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016

score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,272

Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated

Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte

Catégories consensuellesaucune

DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune

Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet

GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune

Score de désaccord entre enseignants0,995

Score d'incertitude au seuil0,207

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,016	0,272
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,002	0,001
Méta-épidémiologie (sens large)	0,002	0,002
Bibliométrie	0,006	0,005
Études des sciences et des technologies	0,004	0,004
Communication savante	0,007	0,004
Science ouverte	0,005	0,005
Intégrité de la recherche	0,009	0,015
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,062	0,033

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,114

Tête enseignante GPT0,411

Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail

Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle